Sovellukset lisenssin mukaan
Valitse lisenssiluokka nähdäksesi lyhyen kuvauksen ja luettelon sovelluksista sekä niitä vastaavista lisensseistä.
Sovellukset, joilla on 'Akateeminen'-lisenssi
Näitä ohjelmistoja voivat käyttää kaikki tutkijat tai opiskelijat, jotka ovat sidoksissa akateemiseen eli tutkintoja myöntävään instituutioon, voittoa tavoittelemattomiin ja ei-kaupallisiin tarkoituksiin. Valtiollisten tutkimuslaitosten tai ei-akateemisten voittoa tavoittelemattomien instituutioiden työntekijöillä ei välttämättä ole oikeutta käyttää ohjelmistoa. Tarkista aina tarkat lisenssiehdot kyseisen sovelluksen sivulta.
Sovellukset, joilla on 'Ilmainen'-lisenssi
Nämä ohjelmistot ovat vapaasti kaikkien käytettävissä useimpiin tarkoituksiin. Tarkista aina tarkat lisenssiehdot kyseisen sovelluksen sivulta.
- ABySS
- ADMIXTURE
- ANGSD
- ASTRAL
- AUGUSTUS
- AdmixTools
- Alphafold
- BBMap
- BCFtools
- BEDOPS
- BEDTools
- BLAST
- BRAKER
- BUSCO
- BWA
- Bakta
- BamTools
- Barrnap
- BayeScan
- Bio-apps
- BioPerl
- Biopython
- Blender
- Bowtie
- Bowtie2
- Bracken
- CD-HIT
- CDO
- CLUMPP
- COMEBin
- CONCOCT
- CP2K
- Canu
- CheckM2
- Chipster_genomes
- Cirq-on-iqm
- CloudCompare
- Clustal Omega
- ClustalW
- Cufflinks
- Cutadapt
- Diamond
- Dorado
- EMBOSS
- Elmer
- Entrez Direct
- Exonerate
- FASTX-Toolkit
- FDSTools
- FFmpeg
- FastQC
- FireWorks
- Foldseek
- Freebayes
- GATK
- GDAL
- GPAW
- GPU-kiihdytetty visualisointi
- GRASS GIS
- GROMACS
- GTDB-Tk
- Geoconda
- GetOrganelle
- Grace
- HISAT2
- HMMER
- HUMAnN
- HeLI-OTS
- HyPhy
- HybPiper
- HyperQueue
- IGV
- IQ-TREE
- Illumina BaseSpace
- InterProScan
- JAX
- Jellyfish
- Julia-Jupyter
- Julia-ohjelmointikieli
- Jupyter
- Jupyter kursseille
- Kraken
- LAMMPS
- Lazypipe
- MACS2/3
- MAFFT
- MAGScoT
- MEME Suite
- MICOM
- MMseqs2
- MUMmer
- MUSCLE
- MUSCLE5
- Mash
- Megahit
- MetaBAT
- MetaHipMer2 (MHM2)
- MetaPhlAn
- Minimap2
- Mothur
- MrBayes
- NCBI C++ Toolkit
- NGS-PrimerPlex
- NWChem
- Nextflow
- ORCA
- Octave
- Open Babel
- OpenDroneMap (ODM)
- OpenFOAM
- Orfeo ToolBox
- PALM
- PANNZER2/SANSPANZ
- PDAL
- PHYLIP
- PLUMED
- ParaView
- Pennylane
- Picard Tools
- Praat
- Prodigal
- Prokka
- PyTorch
- Python
- Python Data
- Python-geo
- QGIS
- QIIME
- Qiskit
- Qiskit-on-iqm
- Quantum ESPRESSO
- R paikkatietoon
- RAxML
- RAxML-NG
- RevBayes
- Roary
- SAGA GIS
- SALMON
- SAMtools
- SNAP
- SPAdes
- SRA Toolkit (sra-tools)
- STAR
- SageMath
- SameStr
- Scalasca
- SemiBin2
- SeqKit
- Seqtk
- Snakemake
- SortMeRNA
- SteadierCom
- StrAuto
- StringTie
- Structure
- Structure Harvester
- TensorBoard
- TensorFlow
- TopHat
- Trimmomatic
- Trinity
- Työpöytä
- VCFtools
- VSEARCH
- VisIt
- Visual Studio Code
- Whisper
- WhiteboxTools
- XHMM (eXome-Hidden Markov Model)
- Zonation
- antiSMASH
- bwa-mem2
- cProfile: Python-profileri
- compute-sanitizer: toiminnallisen oikeellisuuden tarkistustyökalujen kokonaisuus CUDA-ohjelmille
- cuda-gdb: CUDA-virheenjäljitin
- deepTools
- demix_check
- eBayn tsv-utils
- eggNOG-mapper
- fastp
- gapseq
- gdb: GNU-virheenjäljitin
- hifiasm
- iPyrad
- inStrain
- kp-spell
- medaka
- minibwa
- ncu: GPU:n CUDA-ydinprofilointityökalu
- nsys: Nvidian GPU- ja CPU-profilointityökalu
- pdb: Python-virheenjäljitin
- perf
- run_dbcan (dbCAN)
- trankit
- vLLM
- vrt-tools
- wtdbg2
- yak
Sovellukset, joilla on 'Ei-kaupallinen'-lisenssi
Näiden ohjelmistojen käyttö on rajoitettu ei-kaupallisiin tarkoituksiin riippumatta käyttäjän organisaatiosta. Tarkista aina tarkat lisenssiehdot kyseisen sovelluksen sivulta.
Sovellukset, joilla on 'Muu'-lisenssi
Katso lisäohjeet ja lisenssitiedot kyseisten sovellusten sivuilta. Esimerkiksi nämä ohjelmistot voivat edellyttää, että käyttäjä hankkii oman lisenssinsä suoraan kehittäjiltä, tai käyttöoikeuden saaminen voi vaatia lisävaiheita (esim. lisääminen Unix-ryhmään).