IGV

Integrative Genomics Viewer (IGV) on tehokas, interaktiivinen työkalu genomidatan visuaaliseen tarkasteluun, mukaan lukien kohdistetut sekvenssiluvut, variantit ja genomiset annotaatiot.

• IGV
  • Lisenssi
  • Saatavuus
  • Käyttö
  • Tuki
  • Lisätietoja

Lisenssi

Vapaasti käytettävissä ja avointa lähdekoodia MIT-lisenssillä.

Saatavuus

• Roihu: 2.19.7, bio-apps-moduulin kautta.

Käyttö

IGV on graafinen sovellus, joten sitä kannattaa käyttää Roihun selainkäyttöliittymän etätyöpöydän kautta:

1. Avaa Desktop-sovellus Roihun selainkäyttöliittymässä.
2. Avaa pääte valitsemalla Applications -> Terminal Emulator.
3. Lataa moduulit ja käynnistä IGV:n graafinen käyttöliittymä igv.sh-käynnistysskriptillä:

module load bio-apps/v202603
module load igv/2.19.7
igv.sh

Tuki

CSC Service Desk

Lisätietoja

• IGV:n kotisivu
• IGV:n käyttöopas

Onko tämä sivu hyödyllinen?

Kyllä

Kiitos palautteestasi!

Ei

Kiitos! Arvostamme palautettasi.

Kerro meille miten voisimme parantaa tätä sivua ottamalla meihin yhteyttä.