Hyppää sisältöön

Welcome to our weekly research support coffee hour on Zoom! Click here for more information.

Warning!

Puhti scratch disk is becoming very full (80+ % ) resulting in performance degradation. Everybody is advised to only keep actively processed data on scratch, all other data should be deleted, transferred to host institute or stored in Lumi-O. No new quota will be granted. Click here for a tool for examining your disk usage.

Sisällysluettelo käyttöoppaaseen

Datan lataaminen palveluun ja salaaminen

SD Connectiin ladatut tiedostot salataan automaattisesti ja puretaan salauksesta latauksen yhteydessä palvelun integroidun avaintenhallintajärjestelmän avulla. Tämä toiminto tukee kaikkia tiedostotyyppejä ja -muotoja, ja tiedoston enimmäiskoko on 100 GB. Suurempia tiedostoja tai kansioita voidaan ladata palveluun ohjelmallisesti.

Huomio

Kaikki CSC-projektin jäsenet voivat ladata tiedostoja palveluun ja palvelusta SD Connectin kautta. Käyttöoikeuksien rajaamiseksi tiedostoja voidaan jakaa toiselle CSC-projektille (Academic-tyyppi) käyttäen Read to SD Desktop -oikeutta. Jos tarvitset apua, ota yhteyttä osoitteeseen servicedesk@csc.fi (aihe: SD Connect).

Vaihe vaiheelta

1. Suunnittele tarvittavien ylätason kansioiden (ämpäreiden) määrä

SD Connect perustuu pilvipohjaiseen oliotallennusinfrastruktuuriin. Tiedostoja voidaan ladata palveluun vain ylätason kansioon, jota teknisesti kutsutaan ämpäriksi ja joka luodaan SD Connectissa: ylätason "laatikko", jota käytetään tiedostojen tai kansioiden tallentamiseen. Tällä on useita vaikutuksia siihen, miten datasi kannattaa järjestää ja hallita:

  • Kun tiedostot on ladattu SD Connectiin, niitä ei voi muokata tai muuttaa. Siksi ylätason kansiorakenne on tärkeää suunnitella etukäteen. Datanhallinnan yksinkertaistamiseksi ja ongelmien välttämiseksi on suositeltavaa luoda erillinen kansio jokaiselle aineistolle tai kokeelle. Vältä sijoittamasta liian montaa tiedostoa yhteen kansioon; kukin kansio voi sisältää enintään 500.000 segmentoituja tiedostoja.

  • Alikansioita ei tueta: Tiedostojen lataamista palveluun alikansioihin ei tueta.

  • Latauksen kesto: Suurten tiedostojen tai suurten erien lataaminen palveluun voi kestää useita tunteja. Lataukset pysäytetään automaattisesti 8 tunnin jälkeen.

  • Tiedostojen segmentointi: Palveluun ladatut tiedostot jaetaan automaattisesti segmentteihin tallennuksen ja suorituskyvyn optimoimiseksi. Tämä segmentointi ei näy käyttöliittymässä, mutta se voi vaikuttaa suorituskykyyn.

  • Selainkäyttöliittymä voi olla hitaampi, jos kansiossa on yli 2500 tiedostoa. Tässä tapauksessa käytä komentorivikäyttöliittymän työkaluja lataamiseen palveluun ja automaattiseen avaintenhallintaan.

2. Suunnittele ylätason kansion (ämpärin) nimet

Kun luot kansioita SD Connectissa, yhteensopivuuden varmistamiseksi on noudatettava tiettyjä nimeämissääntöjä, joten nimeäminen kannattaa suunnitella etukäteen.

Huomio

Ylätason kansion (ämpärin) nimeä ei voi muuttaa sen jälkeen, kun se on luotu SD Connectissa. Nämä säännöt koskevat vain palvelussa luotuja ylätason kansioita, eivät paikalliselta tietokoneelta ladattuja alikansioita tai tiedostoja.

Ylätason kansioiden (ämpäreiden) nimien tulee:

  • alkaa pienellä kirjaimella tai numerolla.
  • olla 3–63 merkkiä pitkiä.
  • sisältää latinalaisia kirjaimia (a-z), numeroita (0-9) ja yhdysmerkin (-).
  • olla yksilöllisiä kaikkien SD Connectin ja Altaan projektien olemassa olevien kansioiden joukossa. Jos et voi luoda uutta kansiota, toinen projekti saattaa jo käyttää valitsemaasi nimeä. Tämän välttämiseksi on hyvä käytäntö sisällyttää kansion nimeen projektikohtaisia tunnisteita (esim. projektin tunnistenumero tai akronyymi).

Ylätason kansioiden (ämpäreiden) nimet eivät saa sisältää:

  • Isoja kirjaimia, alaviivaa (_) eikä aksentillisia tai erikoismerkkejä sisältäviä kirjaimia (åäöe') ei sallita.
  • kaikki kansioiden nimet ovat julkisia; älä sisällytä niihin luottamuksellisia tietoja.
  • Kansioiden nimiä ei voi muuttaa jälkikäteen.

3. Hyväksy evästeet

Tiedostojen lataamista palveluun tuetaan Google Chrome- ja Mozilla Firefox -selaimissa (incognito-tilaa ei tueta). Ensimmäisellä käyttökerralla selain voi pyytää ponnahdusikkunassa suostumusta evästeiden käyttöön. Evästeiden hyväksyminen mahdollistaa tiedostojen ja kansioiden lataamisen palveluun. Tämä tarvitsee tehdä vain kerran.

4. Lataa ja salaa tiedostot palveluun uuteen ylätason kansioon (ämpäriin)

  1. Kirjaudu SD Connectiin.
  2. Valitse oikea CSC-projekti vasemmasta yläkulmasta.
  3. Napsauta oikeasta yläkulmasta Upload.
  4. Anna tiedostojesi kohdeylätason kansiolle (ämpärille) nimi ottaen huomioon, että jotkin merkit eivät ole sallittuja: isot kirjaimet, alaviivat (_) sekä aksentilliset tai erikoismerkkejä sisältävät kirjaimet (esim. å, ä, ö, é) (katso kohta 2).
  5. Napsauta Select Files avataksesi selainikkunan ja valitaksesi tiedostot latausta varten. Jos haluat ladata kansioita palveluun, vedä ja pudota ne ikkunaan. Aloita automaattinen salaus ja lataus napsauttamalla Upload.
  6. Ilmoitus latauksen tilasta tulee näkyviin ja pysyy näkyvissä, kunnes lataus on valmis. Ilmoitus sisältää myös linkin kohdekansioon.
  7. Kun lataus on valmis, salatuissa tiedostoissa näkyy pääte .c4gh, mikä tarkoittaa, että ne on salattu onnistuneesti.

Tiedostot ovat nyt saatavilla ladattaviksi ja jaettaviksi SD Connectin kautta tai analysoitaviksi, muokattaviksi tai annotoitaviksi sen jälkeen, kun ne on tuotu SD Desktopiin. Kun tiedostot on ladattu palveluun ja tallennettu, palvelu alkaa kuluttaa laskutusyksiköitä (BUs). Tallennustilan oletuskiintiö on 10 TB. Kun tämä raja saavutetaan, latauksia palveluun ei enää hyväksytä, ennen kuin lisätallennustilaa on myönnetty.

SD Connect Upload

5. Lataa ja salaa tiedostot palveluun olemassa olevaan ylätason kansioon (ämpäriin)

  1. Valitse oikea kansio.
  2. Napsauta oikeasta yläkulmasta Upload ja seuraa yllä olevan kohdan vaiheita 5–9.

6. Luo ylätason kansio (ämpäri)

Voit luoda kansion ja ladata tiedostoja siihen myöhemmin.

  1. Napsauta Create folder.
  2. Anna kansiollesi nimi ottaen huomioon, että jotkin merkit eivät ole sallittuja: isot kirjaimet, alaviivat (_) sekä aksentilliset tai erikoismerkkejä sisältävät kirjaimet (esim. å, ä, ö, é) (katso kohta 2).
  3. Napsauta Save.

SD Connect Create folder

Seuraavat vaiheet tässä oppaassa

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta