Sovellukset
Etkö löydä etsimääsi sovellusta?
- Täältä löydät keinoja sovellusten asentamiseksi itse .
- Voit myös ottaa yhteyttä CSC:n asiakaspalveluun pyytääksesi sovellusta asennettavaksi. Voimme harkita tietyn sovelluksen esiasennusta—tai lisenssin hankkimista sille, mikäli kyseessä ei ole avoin sovellus—, jos sovellukselle on tarpeeksi kysyntää.
- Emme voi luvata esiasentavamme kaikkia pyydettyjä sovelluksia, mutta CSC:n asiakaspalvelu neuvoo mielellään sovellusten asennuksessa.
Sovellukset aakkosjärjestyksessä
A
- Abaqus
- ABySS
- Accelerated visualization
- AdmixTools
- ADMIXTURE
- Alphafold
- Amber
- AMS
- AMS-GUI
- ANGSD
- Ansys
- antiSMASH
- ArcGIS Python API
- ASTRAL
- AUGUSTUS
B
- Bakta
- BamTools
- Barrnap
- BayeScan
- BBMap
- BCFtools
- BEDOPS
- BEDTools
- Bio-apps
- BioPerl
- Biopython
- BLAST
- Blender
- Bowtie
- Bowtie2
- Bracken
- BRAKER
- BUSCO
- BWA
- bwa-mem2
C
- Canu
- CD-HIT
- CDO
- CheckM2
- Chipster — Easy-to-use analysis platform for RNA-seq, single cell RNA-seq and other NGS data
- Chipster_genomes
- Cirq-on-iqm
- CloudCompare
- CLUMPP
- Clustal Omega
- ClustalW
- COMEBin
- compute-sanitizer
- COMSOL Multiphysics
- CONCOCT
- COSMO-RS
- CP2K
- cProfile
- CryoSPARC
- CSD
- cuda-gdb
- Cufflinks
- Cutadapt
D
E
F
- fastp
- FastQC
- FASTX-Toolkit
- FDSTools
- FFmpeg
- Finnish Tagtools — Finnish Tagtools
- FireWorks
- Foldseek
- Freebayes
G
H
- HADDOCK3
- HeLI-OTS
- HFST — Helsinki Finite-State Transducer Technology
- HFST-fi — Helsinki Finite-State Technology for Finnish
- HFST-sv — Helsinki Finite-State Technology for Swedish
- hifiasm
- HISAT2
- HMMER
- HUMAnN
- HybPiper
- HyperQueue
- HyPhy
I
J
K
L
M
- MACS2/3
- Maestro
- MAFFT
- MAGScoT
- Mash
- MATLAB
- medaka
- MedeA
- Megahit
- MEME Suite
- MetaBAT
- MetaHipMer2
- MetaPhlAn
- MICOM
- minibwa
- Minimap2
- MMseqs2
- Molden
- MOLPRO
- Mothur
- MrBayes
- MUMmer
- MUSCLE
- MUSCLE5
N
O
P
- PALM
- PANNZER2/SANSPANZ
- ParaView
- PDAL
- pdb
- Pennylane
- perf
- PHYLIP
- Picard Tools
- PLUMED
- Praat
- Prodigal
- Prokka
- Python
- Python Data
- Python-geo
- PyTorch
Q
R
S
- SAGA GIS
- SageMath
- SALMON
- SameStr
- SAMtools
- Scalasca
- SemiBin2
- SeqKit
- Seqtk
- Snakemake
- SNAP
- SortMeRNA
- SPAdes
- SRA Toolkit
- STAR
- Star-CCM+
- SteadierCom
- StrAuto
- StringTie
- Structure
- Structure Harvester