Hyppää sisältöön

A new version of SD Connect and SD Desktop will be available from Monday, September 28. The major upgrade will introduce significant improvements, but also includes changes that are not compatible with the current version of the service. Click here to review the available support materials.

Warning!

Puhti and Mahti computing services have been decommissioned and no new jobs are accepted or executed on its compute nodes. Puhti and Mahti login nodes and storage services are planned to remain available until 15 October 2026. Clean up unnecessary files and move any data you need to keep by 31 August 2026. See the Roihu data migration guide for instructions on transferring your data to Roihu.

Sisällysluettelo käyttöoppaaseen

Federoitu eurooppalainen genomi-fenomiarkisto (FEGA)

Federoitu eurooppalainen genomi-fenomiarkisto (FEGA) on palvelu tutkimuskäyttöön suostumuksen saaneen ihmisen geneettisen datan ja fenotyyppiaineiston tallentamiseen ja julkaisemiseen. Palvelu perustuu paikallisten repositorioiden kansainväliseen verkostoon. CSC ylläpitää Suomen FEGA-palvelua. Huomaa, että tämä käyttöopas koskee nimenomaan Suomen FEGA-palvelua.

Voit käyttää FEGAa biolääketieteellisten aineistojen toimittamiseen FEGA-julkaisuun rajoitetuin käyttöoikeuksin. SD Apply -palvelussa voit hakea käyttöoikeutta FEGAssa julkaistuihin aineistoihin tai hyväksyä niitä koskevia pyyntöjä. Palveluun toimitettu sensitiivinen tutkimusdata säilyy Suomessa, ja samalla dataa kuvaava julkinen tieto (metadata) saatetaan kansainvälisesti saataville keskus-European Genome-phenome Archivessa (EGA). Jokaisella aineistolla tulee olla Data Access Committee (DAC), joka arvioi käyttölupahakemukset ja voi myöntää tai evätä datan käyttöoikeuden uudelleenkäyttöä varten SD Apply -palvelussa. Jos hakemus hyväksytään, hakija voi käyttää sensitiivistä dataa suoraan ja analysoida sitä turvallisessa ja yksityisessä pilvityötilassa käyttäen CSC:n sensitiivisen datan palveluita tutkimukselle. Datan julkaiseminen FEGAssa edellyttää erillistä sopimusta CSC:n kanssa. Valitse alta oikea käyttöopas:

Haluan ...


Hyödyllistä terminologiaa

  • Keskus-EGA. Central European Genome-phenome Archive. Kun dataa toimitetaan FEGA-julkaisuun, metadata saatetaan kansainvälisesti saataville keskus-EGAssa.

  • Data Access Committee (DAC). Henkilö tai henkilöryhmä, joka toimii FEGAan tallennetun aineiston rekisterinpitäjänä ja vastaa kyseiseen aineistoon kohdistuvien käyttöoikeuspyyntöjen hyväksymisestä tai hylkäämisestä.

  • Datan hakija. Henkilö, joka hakee käyttöoikeutta FEGAan tallennettuun sensitiiviseen dataan.

  • Datan toimittaja. Henkilö, joka lataa dataa FEGA-palveluun uudelleenkäyttöä varten rajoitetuin käyttöoikeuksin ja kuvailee sen julkisesti saataville tulevalla metadatalla. Datan toimittaja edustaa aineiston omistajaorganisaatiota toimitusprosessin aikana.

  • Suomen FEGA. Kansallinen repositorio tutkimuskäyttöön suostumuksen saaneelle biolääketieteelliselle datalle. CSC ylläpitää Suomen FEGA-palvelua. Suomen FEGAan ladattu tutkimusdata säilyy Suomessa rajoitetuin käyttöoikeuksin.

Note

Lisätietoja on Federated EGA -palvelukuvauksessa CSC:n palvelukatalogissa ja CSC:n sensitiivisen datan palveluita tutkimukselle -verkkosivulla.

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta