Hyppää sisältöön

Welcome to our weekly research support coffee hour on Zoom! Click here for more information.

Warning!

Puhti scratch disk is becoming very full (80+ % ) resulting in performance degradation. Everybody is advised to only keep actively processed data on scratch, all other data should be deleted, transferred to host institute or stored in Lumi-O. No new quota will be granted. Click here for a tool for examining your disk usage.

Sisällysluettelo käyttöoppaaseen

Federoitu eurooppalainen genomi-fenomiarkisto (FEGA)

Federoitu eurooppalainen genomi-fenomiarkisto (FEGA) on palvelu tutkimuskäyttöön suostumuksen saaneen ihmisen geneettisen datan ja fenotyyppiaineiston tallentamiseen ja julkaisemiseen. Palvelu perustuu paikallisten repositorioiden kansainväliseen verkostoon. CSC ylläpitää Suomen FEGA-palvelua. Huomaa, että tämä käyttöopas koskee nimenomaan Suomen FEGA-palvelua.

Voit käyttää FEGAa biolääketieteellisten aineistojen toimittamiseen FEGA-julkaisuun rajoitetuin käyttöoikeuksin. SD Apply -palvelussa voit hakea käyttöoikeutta FEGAssa julkaistuihin aineistoihin tai hyväksyä niitä koskevia pyyntöjä. Palveluun toimitettu sensitiivinen tutkimusdata säilyy Suomessa, ja samalla dataa kuvaava julkinen tieto (metadata) saatetaan kansainvälisesti saataville keskus-European Genome-phenome Archivessa (EGA). Jokaisella aineistolla tulee olla Data Access Committee (DAC), joka arvioi käyttölupahakemukset ja voi myöntää tai evätä datan käyttöoikeuden uudelleenkäyttöä varten SD Apply -palvelussa. Jos hakemus hyväksytään, hakija voi käyttää sensitiivistä dataa suoraan ja analysoida sitä turvallisessa ja yksityisessä pilvityötilassa käyttäen CSC:n sensitiivisen datan palveluita tutkimukselle. Datan julkaiseminen FEGAssa edellyttää erillistä sopimusta CSC:n kanssa. Valitse alta oikea käyttöopas:

Haluan ...


Hyödyllistä terminologiaa

  • Keskus-EGA. Central European Genome-phenome Archive. Kun dataa toimitetaan FEGA-julkaisuun, metadata saatetaan kansainvälisesti saataville keskus-EGAssa.

  • Data Access Committee (DAC). Henkilö tai henkilöryhmä, joka toimii FEGAan tallennetun aineiston rekisterinpitäjänä ja vastaa kyseiseen aineistoon kohdistuvien käyttöoikeuspyyntöjen hyväksymisestä tai hylkäämisestä.

  • Datan hakija. Henkilö, joka hakee käyttöoikeutta FEGAan tallennettuun sensitiiviseen dataan.

  • Datan toimittaja. Henkilö, joka lataa dataa FEGA-palveluun uudelleenkäyttöä varten rajoitetuin käyttöoikeuksin ja kuvailee sen julkisesti saataville tulevalla metadatalla. Datan toimittaja edustaa aineiston omistajaorganisaatiota toimitusprosessin aikana.

  • Suomen FEGA. Kansallinen repositorio tutkimuskäyttöön suostumuksen saaneelle biolääketieteelliselle datalle. CSC ylläpitää Suomen FEGA-palvelua. Suomen FEGAan ladattu tutkimusdata säilyy Suomessa rajoitetuin käyttöoikeuksin.

Note

Lisätietoja on Federated EGA -palvelukuvauksessa CSC:n palvelukatalogissa ja CSC:n sensitiivisen datan palveluita tutkimukselle -verkkosivulla.

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta