LAStools

LAStools on kokoelma työkaluja LiDAR-datan käsittelyyn.

Käyttö

LAStoolsin käyttö

LAStools sisältyy seuraaviin moduuleihin:

lastools: 2026 (tarkemmin 260326) Roihussa
lastools: 2026 (tarkemmin 260326), 2025 (250304), 2023 (230914) ja 2022 (220613) Puhdissa
geoconda: 3.11.9, 3.10.9 ja 3.10.6 (kaikissa vanhempi 20171231) Puhdissa

Lataa jokin näistä moduuleista, esimerkiksi uusin versio (oletus):

module load lastools

LAStoolsin versiot 2023–2026 perustuvat uuteen LAStoolsin natiiviin Linux-versioon, ja ne vaativat 64-päätteen kaikkien työkalujen loppuun. Voit testata, että LAStools-moduuli on latautunut onnistuneesti komennolla

lasinfo64 -h

Kaikissa vanhemmissa versioissa, esimerkiksi geoconda-moduulissa, työkalun nimen lopusta pitää jättää 64 pois, esimerkiksi:

lasinfo -h

Jos haluat käyttää lisensoituja työkaluja testaukseen, käytä komennossa valitsinta -demo; lisätietoja on LAStoolsin dokumentaatiossa.

LAStools-komennot

Kaikki LAStools-asennukset Puhdissa sisältävät LAStoolsin avoimen lähdekoodin työkalut.

las2las - poimii viimeiset paluut, leikkaa, osittaa, muuntaa jne.
las2txt - muuntaa LASin ihmisen luettavaan ja helposti jäsennettävään ASCII-muotoon
lasdiff - vertaa kahden LAS/LAZ/ASCII-tiedoston dataa
lasindex - luo spatiaalisen LAX-indeksitiedoston nopeita paikkatietokyselyjä varten
lasinfo - tulostaa nopean yleiskatsauksen LAS-tiedoston sisällöstä
lasmerge - yhdistää useita LAS- tai LAZ-tiedostoja yhdeksi LAS- tai LAZ-tiedostoksi
lasprecision - analysoi LIDAR-pisteiden todellisen tarkkuuden
laszip - pakkaa LAS-tiedostot täysin häviöttömästi
txt2las - muuntaa LIDAR-datan ASCII-tekstistä binääriseen LAS-muotoon

Versiot 2023–2026 sisältävät myös: lasoptimize64, las2dem64, las2iso64, las2shp64, las2tin64, las3dpoly64, lasboundary64, lascanopy64, lasclassify64, lasclip64, lascolor64, lascontrol64, lascopy64, lasdatum64, lasdistance64, lasduplicate64, lasgrid64, lasground64, lasground_new64, lasheight64, lasintensity64, laslayers64, lasnoise64, lasoverage64, lasoverlap64, lasreturn64, lassort64, lassplit64, lasthin64, lastile64, lastrack64, lasvdatum64, lasvoxel64. Versiossa 2025 on lisäksi: blast2dem64, demdiff64, demzip64, e572las64, lascopcindex64, laslicman64, lasplanes64, lasprobe64 and shp2las64. Katso näiden työkalujen käyttöehdot lisenssistä.

Versio 2023 ei tue moniydinprosessointia, mutta versiot 2025 ja 2026 tukevat.

Puhdissa ja Roihussa vain komentorivityökalut ovat saatavilla ilman graafista käyttöliittymää.

Lisensoidun version käyttö

CSC tarjoaa vain LAStoolsin "free"-version. Jos sinulla on oma LAStools-lisenssi, sitä voidaan myös käyttää.

Jos haluat käyttää natiivia Linux-versiota, kopioi lisenssitiedosto projektisi projapp-hakemistoon ja anna lisenssitiedoston sijainti ympäristömuuttujana ennen työkalujen käyttöä:

export LAStoolsLicenseFile=/projappl/project_200xxxx/yyy/lastoolslicense.txt

Maanmittauslaitoksen lidar-data Puhdissa

Suomen kansallinen lidar-data on jo tallennettu Puhtiin. Löydät sen tiedostopolusta: /appl/data/geo/mml/laserkeilaus. Lisätietoja.

LAStools monien tiedostojen kanssa

Jos käsittelet suurta määrää lidar-tiedostoja LAStoolsilla, tiedostot on mahdollista käsitellä rinnakkain Puhdissa.

Jos käytät enintään 40 ydintä (=1 solmu Puhdissa), paras vaihtoehto on GNU parallel - katso lisätietoja CSC:n rinnakkaisen GDAL-käytön esimerkistä.
Monisolmukäyttöön katso Ohje: GNU Parallel -työvuo monille pienille, itsenäisille ajoille.

Lisenssi

Tietoa LAStoolsin laillisesta käytöstä ja lisensoinnista on LAStoolsin LICENSE-tiedostossa.

Kiitokset

Jos käytät tätä ohjelmistoa Puhdissa, mainitse CSC ja Geoportti julkaisuissasi; tämä on tärkeää projektin jatkuvuuden ja rahoitusraporttien kannalta. Voit esimerkiksi kirjoittaa: "The authors wish to thank CSC - IT Center for Science, Finland (urn:nbn:fi:research-infras-2016072531) and the Open Geospatial Information Infrastructure for Research (Geoportti, urn:nbn:fi:research-infras-2016072513) for computational resources and support".

Viittaus

Ohjelmiston viittaus riippuu siitä, mitä lisenssiä käytettiin:

LAStools, "Efficient LiDAR Processing Software" (version 220613, academic), obtained from http://rapidlasso.com/LAStools
M. Isenburg, "LAStools - efficient LiDAR processing software" (version 220613, unlicensed), obtained from http://rapidlasso.com/LAStools
rapidlasso GmbH, "LAStools - efficient LiDAR processing software" (version 220613, commercial), obtained from http://rapidlasso.com/LAStools

Asennus

Versiot 2023–2026 asennettiin Puhtiin Singularity-kontilla, joka perustuu CSC:n LasTools Apptrainer -resepteihin ja Tykyn wrap-container-toiminnallisuuteen.

#2025 and 2026
wrap-container -w /opt/LAStools/bin lastools_2025.sif --prefix 2025

#2023
wrap-container -w /opt/LAStools lastools.sif --prefix 2023

Versio 2022 asennettiin Puhtiin Tykyn wrap-container-toiminnallisuudella käyttäen LAStoolsin Dockerhubin Docker imagea.

wrap-container -w /opt/LAStools docker//:pydo/lastools:latest --prefix 2022