AMS-GUI

AMS:n mukana tulee integroitu GUI (graafinen käyttöliittymä), joka tekee mallinnustehtävien määrittämisestä, ajamisesta ja analysoinnista helppoa. Voit testata GUI:ta supertietokoneiden selainkäyttöliittymien kautta, mutta laajempaan käyttöön suosittelemme GUI:n asentamista omalle kannettavalle tietokoneellesi tai työasemallesi.

Lisenssi

Katso AMS:n lisenssiosio.

Käyttö

Käytä selaimen kautta

Siirry Roihun selainkäyttöliittymään verkkoselaimella ja kirjaudu sisään CSC-käyttäjätunnuksellasi.

Käynnistä siellä Desktop. Käynnistyksen yhteydessä pyydä Desktop-istunnollesi muutama CPU-ydin (esim. 4), jos aiot ajaa lyhyitä töitä suoraan GUI:sta — tämä tekee myös 3D-näkymästä huomattavasti sulavamman.
Avaa Terminal ja siirry sopivaan työhakemistoon.
Lataa AMS-moduuli module load ams/2026.105.
Käynnistä syötteenrakennustyökalu komennolla ams_ood (ei pelkkä amsinput), joka suorittaa esioptimoijan ja lyhyet File-> Run -ajot oikein selain-Desktopissa. Käynnistyminen voi kestää jonkin aikaa.
Rakenna työsi ja tallenna se (File-> Save).

Lyhyet työt voidaan käynnistää suoraan GUI:sta (File-> Run), mutta pidemmät työt tulee lähettää eräajojonoon. Kaikki tallennetut työt, sekä lasketut että laskemattomat, löytyvät GUI:ssa kohdasta SCM-> Jobs. Ennen kuin lähetät työn eräajojonoon, sinun on määriteltävä, mitä resursseja se tarvitsee (aika, muisti, ytimien määrä jne.).

Valitse kohdassa SCM-> Jobs Queue -> New -> SLURM
Queue Name: My_testqueue. Voit tallentaa jonoja eri nimillä eri resurssipyyntöjä varten
Remote host:. Jätä tyhjäksi
Remote user:. Jätä tyhjäksi
Remote job directory:. Jätä tyhjäksi
Run command: sbatch --partition=test --ntasks=8 --mem-per-cpu=1500M --account=<yourproject> --time=00:15:00 "$job" Korvaa <yourproject> oikealla projektin nimellä. Voit käyttää samoja komentorivivalintoja kuin AMS:n eräajoskriptiesimerkeissä. Huomaa, että Roihussa muistia pyydetään ytimien määrästä riippumatta, esimerkiksi valinnalla --mem-per-cpu.
Use Local Batch: yes
Prolog command: export SCM_TMPDIR=/scratch/<yourproject>; source /appl/soft/manual/chem/x86_64/AMS/ams2026.105/ams_csc.bash Tämä alustaa AMS-ympäristön. Aseta SCM_TMPDIR siihen scratch-hakemistoon, jota haluat käyttää; jos kuulut useaan projektiin, valitse sopiva /scratch/project_XXXXXXX.

Valitse lähetettävä työ (SCM-> Jobs), käytettävä jono (Queue) ja lähetä työ komennolla Job-> Run.

Asenna oma GUI

CSC:n hankkima AMS-lisenssi sallii CSC:n akateemisten asiakkaiden asentaa AMS-GUI:n omalle tietokoneelleen. Näin käyttäjä voi kätevästi rakentaa ja määrittää laskentamallin. Kun malli on valmis, varsinainen laskentatehtävä lähetetään CSC:n palvelimille ja suoritetaan siellä. Tulokset voidaan sitten noutaa ja analysoida paikallisella tietokoneella. Huomaa, että paikallisen asennuksen lisenssi kattaa vain AMS-GUI:n, ja se on voimassa vain akateemiseen käyttöön (ei viranomais- tai kaupalliseen tutkimukseen).

1. Pyydä tunnukset

Pyydä tunnukset AMS-GUI:n lataamista varten CSC:n asiakastuesta. Lisää aihekenttään tunniste AMS-GUI. Huomaa, että lisenssi kattaa CSC:ssä vain akateemisen käytön (ei viranomais- tai kaupallista tutkimusta). Tunnukset nollataan 6 kuukauden välein.

2. Lataa

Hae koneellesi sopiva binaaritiedosto SCM:n verkkosivustolta käyttäen:

SCM User ID: <the User ID you got from servicedesk@csc.fi>
Password: <the password you got from servicedesk@csc.fi>

3. Asenna

Windows: suorita exe järjestelmänvalvojan oikeuksilla ja hyväksy kaikki oletusasetukset.
Mac: avaa dmg ja vedä AMS2026.xxx-kohde Applications-hakemistoon.
Linux: pura tgz-paketti ja source-komennolla lataa amsbashrc.sh AMS:n asennushakemistossa.

Lisätietoja on AMS:n asennusoppaassa.

4. Käynnistä

Windows: kaksoisnapsauta AMSjobs-pikakuvaketta
Mac: suorita AMS2026.xxx-sovellus
Linux: määritä ympäristösi (source $HOME/ams2026.xxx/amsbashrc.sh) ja suorita amsjobs

Kun käynnistät AMS:n ensimmäisen kerran, sinulta pyydetään käyttäjätunnus, salasana ja sähköpostiosoite. Lisenssi pitäisi hakeutua automaattisesti internetistä.

5. Hallitse eräajotöitä

Jotta voit hallita etätöitä, sinun on määritettävä SSH-yhteys työasemasi ja supertietokoneen välille, katso SSH-avainten käyttöönotto.

Roihu vaatii SSH-varmenteet

Jotta voit muodostaa SSH-yhteyden Roihuun, sinun täytyy allekirjoittaa julkinen avaimesi MyCSC:ssä saadaksesi aikaperusteisen SSH-varmenteen. Kukin varmenne on voimassa 24 tuntia, minkä jälkeen se on uusittava. Tavalliset julkiset avaimet tiedostossa ~/.ssh/authorized_keys eivät toimi Roihussa, joten etätöiden hallinta AMS-GUI:sta toimii vain niin kauan kuin varmenteesi on voimassa.

Kaikki tallennetut työt, sekä lasketut että laskemattomat, löytyvät GUI:sta kohdasta SCM-> Jobs. Ennen kuin lähetät työn eräajojonoon, sinun on määriteltävä, mitä resursseja se tarvitsee (aika, muisti, ytimien määrä jne.).

Valitse Queue -> New -> SLURM
Queue Name: My_testqueue. Voit tallentaa jonoja eri nimillä eri resurssipyyntöjä varten
Remote host: roihu-cpu.csc.fi.
Remote user: <your CSC username>
Remote job directory: /scratch/<yourproject>
Run command: sbatch --partition=test --ntasks=8 --mem-per-cpu=1500M --account=<yourproject> --time=00:15:00 "$job" Korvaa <yourproject> oikealla projektin nimellä. Voit käyttää samoja komentorivivalintoja kuin AMS:n eräajoskriptiesimerkeissä.
Use Local Batch: no
Prolog command: export SCM_TMPDIR=/scratch/<yourproject>; source /appl/soft/manual/chem/x86_64/AMS/ams2026.105/ams_csc.bash