-
COSMO-RS
COSMO-RS
COSMOsuite on kattava työkalupakki fluidifaasin ominaisuuksien mallintamiseen ja ennustamiseen COSMO-RS-mallin avulla. Työkalupakki koostuu komponenteista COSMOtherm, COSMOconf, COSMOplex, COSMObase ja COSMOquick.
COSMOtherm on komentorivi-/tiedosto-ohjattu ohjelma, jota voidaan ajaa suoraan UNIX- tai DOS-komentotulkista. Sen avulla voidaan laskea minkä tahansa liuottimen tai liuotinsekoituksen sekä liuenneen aineen tai liuenneiden aineiden systeemin ominaisuuksia vaihtelevassa lämpötilassa ja paineessa. COSMOtherm käyttää COSMO-RS-teoriasta johdettuja kemiallisia potentiaaleja erilaisten tasapainotermodynaamisten ominaisuuksien tai niistä johdettujen suureiden laskemiseen. COSMOthermissa on komentoriviohjelman graafinen käyttöliittymä. Sen avulla ohjelmaa voidaan käyttää vuorovaikutteisesti, eli valita yhdisteitä, valmistella ominaisuuksien syötteitä, ajaa ohjelma ja tarkastella laskennan tuloksia.
COSMOconf on joustava työkalupakki konformeerien generointiin. COSMOconfia voidaan käyttää yhdessä TURBOMOLE -paketin kanssa COSMO-tiedostojen tuottamiseen olennaisille konformaatioille. Sen avulla voit käyttää ennalta määriteltyjä menettelyjä, jotka on optimoitu COSMO-RS:n kannalta olennaisimpien konformeerien tuottamiseen. COSMOconfia voidaan käyttää graafisen käyttöliittymän kautta tai komentoriviltä.
COSMOplex on työkalu COSMO-RS:ään perustuvien itseorganisoituvien epähomogeenisten systeemien simulointiin. COSMOconfia voidaan käyttää graafisen käyttöliittymän kautta tai komentoriviltä.
Saatavuus
- Puhdissa: 2024
Lisenssi
- Voit käyttää ohjelmistoa ainoastaan voittoa tavoittelemattomaan tutkimukseen.
- Vain akateemisten (eli tutkintoja myöntävien) instituutioiden käyttäjät saavat käyttää ohjelmistoa.
Käyttö
Käytä graafista käyttöliittymää selaimella
Siirry Puhdin selainkäyttöliittymään verkkoselaimella ja kirjaudu sisään CSC-käyttäjätunnuksellasi tai Haka-federaation kautta.
- Käynnistä siellä Desktop.
- Avaa
Terminalja siirry sopivaan työhakemistoon. - Lataa COSMO-RS-moduuli:
module load cosmors/2024. - Lisää käynnistyskuvakkeet työpöydälle komennolla
setup_cosmodesktop.sh. - Käynnistä esimerkiksi
COSMOthermkaksoisnapsauttamalla sen työpöytäkuvaketta.
Aja komentoriviltä
Alusta COSMO-RS-ympäristö:
Dokumentaatio
Uusin dokumentaatio löytyy hakemistosta /appl/soft/chem/cosmors/Documentation/ PDF-tiedostoina.
Vanhempi dokumentaatio verkossa: