Python Data

Python-kirjastojen kokoelma data-analytiikkaan ja koneoppimiseen.

Uutiset

31.3.2026 Python-data on nyt saatavilla Roihussa. Oletusversio Roihu-CPU:ssa on python-data/3.12-31.03 ja Roihu-GPU:ssa python-data/3.12-20.04.

Saatavilla

Versiot numeroidaan muodossa X.Z-YY.MM, jossa X.Z on Python-tulkin versio ja YY.MM on asennuksen vuosi ja kuukausi. Tyypillisesti moduuli sisältää asennushetkellä kirjastojen uusimmat versiot siinä määrin kuin ohjelmistoriippuvuudet sallivat.

Nykyiset versiot Roihussa ovat:

Roihu-CPU: (oletusversio) python-data/3.12-31.03: asennettu maaliskuussa 2026, sisältää esimerkiksi Scikit-learnin 1.8.0:n, SciPyn 1.17.1:n, Pandasin 2.3.3:n ja JupyterLabin 4.5.6:n.
Roihu-GPU: (oletusversio) python-data/3.12-20.04: asennettu huhtikuussa 2026, sisältää esimerkiksi Cupyn 14.0.1:n Roihu-CPU:n python-datassa saatavilla olevien Python-kirjastojen lisäksi.
Roihu-GPU: python-data/3.10-17.04: asennettu huhtikuussa 2026, sisältää oletusarvoisessa Roihu-GPU:n python-data-ympäristössä saatavilla olevat Python-kirjastot Python 3.10:llä.
Roihu-CPU: python-data/3.10-03.07: asennettu heinäkuussa 2026, sisältää oletusarvoisessa Roihu-CPU:n python-data-ympäristössä saatavilla olevat Python-kirjastot Python 3.10:llä.

Python-data pyrkii sisältämään kattavan valikoiman Python-kirjastoja data-analytiikkaan ja koneoppimiseen, esimerkiksi:

Dask: skaalautuva analytiikka Pythonissa
Gensim: aihemallinnus
Jupyter ja JupyterLab
Marimo (Roihu)
NLTK: luonnollisen kielen työkalupakki
[Polars] (https://docs.pola.rs): laajamittainen data-analytiikka
PyTables
SciPy, mukaan lukien NumPy, Matplotlib ja Pandas
Scikit-learn: koneoppiminen Pythonissa
Seaborn: tilastollinen datan visualisointi

Napsauta nähdäksesi python-data/3.12-31.03:n täydellisen pakkausluettelon

absl-py 2.4.0
aiohappyeyeballs 2.6.1
aiohttp 3.13.5
aiohttp-cors 0.8.1
aiosignal 1.4.0
alabaster 1.0.0
alembic 1.18.4
altair 6.0.0
annotated-doc 0.0.4
annotated-types 0.7.0
anyio 4.13.0
argon2-cffi 25.1.0
argon2-cffi-bindings 25.1.0
arrow 1.4.0
arviz 1.1.0
arviz-base 1.1.0
arviz-plots 1.1.0
arviz-stats 1.1.0
ase 3.29.0
astroid 4.0.4
asttokens 3.0.1
async-lru 2.3.0
async-timeout 5.0.1
asyncssh 2.22.0
attrs 26.1.0
autopep8 2.0.4
babel 2.18.0
backports.tarfile 1.2.0
backports.zstd 1.3.0
banduppy 1.0.1.dev0
bcrypt 5.0.0
beautifulsoup4 4.14.3
bibtexparser 1.4.4
binaryornot 0.6.0
black 26.3.1
bleach 6.3.0
blinker 1.9.0
bokeh 3.9.0
boto3 1.42.89
botocore 1.42.89
Brotli 1.2.0
cached-property 1.5.2
cachetools 6.2.6
cattrs 26.1.0
certifi 2026.4.22
cffi 2.0.0
cftime 1.6.5
chardet 5.2.0
charset-normalizer 3.4.7
click 8.3.2
cloudpickle 3.1.2
colorama 0.4.6
colorful 0.5.8
comm 0.2.3
cons 0.4.7
contourpy 1.3.3
cookiecutter 2.7.1
cryptography 46.0.7
cycler 0.12.1
Cython 3.2.4
cytoolz 1.1.0
dash 4.1.0
dash-bootstrap-components 2.0.4
dash-bootstrap-templates 2.1.0
dask 2026.3.0
dask-glm 0.3.2
dask-jobqueue 0.9.0
dask_labextension 7.0.0
dask-ml 2025.1.0
databricks-sdk 0.102.0
debtcollector 3.1.0
debugpy 1.8.20
decorator 5.2.1
defusedxml 0.7.1
Deprecated 1.3.1
diff-match-patch 20241021
dill 0.4.1
distlib 0.4.0
distributed 2026.3.0
dnspython 2.8.0
docker 7.1.0
docstring-to-markdown 0.17
docutils 0.22.4
email-validator 2.3.0
entrypoints 0.4
et_xmlfile 2.0.0
etuples 0.3.10
exceptiongroup 1.3.1
executing 2.2.1
fastapi 0.135.3
fastapi-cli 0.0.23
fastar 0.11.0
fastjsonschema 2.21.2
fasttext 0.9.2
filelock 3.25.2
flake8 7.1.2
Flask 3.1.3
flask-cors 6.0.2
fonttools 4.62.0
fortio 0.4
fqdn 1.5.1
frozenlist 1.7.0
fsspec 2026.3.0
future 1.0.0
gensim 4.4.0
gitdb 4.0.12
GitPython 3.1.46
google-api-core 2.30.3
google-auth 2.49.2
googleapis-common-protos 1.74.0
graphene 3.4.3
graphql-core 3.2.8
graphql-relay 3.2.0
greenlet 3.4.0
grpcio 1.78.1
gssapi 1.11.1
gunicorn 23.0.0
h11 0.16.0
h2 4.3.0
h5py 3.16.0
hpack 4.1.0
httpcore 1.0.9
httptools 0.7.1
httpx 0.28.1
huey 2.6.0
hyperframe 6.1.0
hyperopt 0.2.7
idna 3.11
imagecodecs 2026.3.6
imageio 2.37.0
imagesize 2.0.0
imbalanced-learn 0.14.1
importlib_metadata 8.7.0
importlib_resources 7.1.0
inflection 0.5.1
iniconfig 2.3.0
intervaltree 3.1.0
invoke 3.0.3
ipdb 0.13.13
ipykernel 6.31.0
ipython 9.12.0
ipython-genutils 0.2.0
ipython_pygments_lexers 1.1.1
ipywidgets 8.1.8
irrep 3.1.1
iso8601 2.1.0
isodate 0.7.2
isoduration 20.11.0
isort 8.0.1
itsdangerous 2.2.0
jaraco.classes 3.4.0
jaraco.context 6.1.1
jaraco.functools 4.4.0
jedi 0.19.2
jeepney 0.9.0
jellyfish 1.2.1
Jinja2 3.1.6
jmespath 1.1.0
joblib 1.5.3
json5 0.14.0
jsonpointer 3.1.1
jsonschema 4.26.0
jsonschema-specifications 2025.9.1
jupyter_client 8.8.0
jupyter_core 5.9.1
jupyter-events 0.12.0
jupyter-lsp 2.3.1
jupyter-resource-usage 1.2.1
jupyter_server 2.17.0
jupyter_server_proxy 4.5.0
jupyter_server_terminals 0.5.4
jupyterlab 4.5.6
jupyterlab_git 0.52.0
jupyterlab_pygments 0.3.0
jupyterlab_server 2.28.0
jupyterlab_widgets 3.0.16
jupytext 1.19.1
kaggle 2.0.1
kagglesdk 0.1.17
keyring 25.7.0
keystoneauth1 5.13.1
kiwisolver 1.5.0
lark 1.3.1
lazy-loader 0.5
lightgbm 4.6.0
llvmlite 0.47.0
lmdb 2.1.1
locket 1.0.0
logical-unification 0.4.7
logzero 1.7.0
loro 1.10.3
lsprotocol 2025.0.0
lxml 6.1.1
lz4 4.4.5
Mako 1.3.10
marimo 0.23.1
Markdown 3.10.2
markdown-it-py 4.0.0
MarkupSafe 3.0.3
matplotlib 3.10.8
matplotlib-inline 0.2.1
mccabe 0.7.0
mdit-py-plugins 0.5.0
mdurl 0.1.2
miniKanren 1.0.5
mistune 3.2.0
mlflow 3.10.1
mlflow-skinny 3.10.1
mlflow-tracing 3.10.1
monty 2026.7.16
more-itertools 11.0.2
mpmath 1.3.0
msgpack 1.1.2
msgspec 0.21.0
multidict 6.7.1
multipledispatch 0.6.0
munkres 1.1.4
mypy_extensions 1.1.0
narwhals 2.19.0
nbclassic 1.3.3
nbclient 0.10.4
nbconvert 7.17.1
nbdime 4.0.4
nbformat 5.10.4
nest_asyncio 1.6.0
netaddr 1.3.0
netCDF4 1.7.4
networkx 3.6.1
nltk 3.9.4
notebook 7.5.5
notebook_shim 0.2.4
numba 0.65.0
numexpr 2.14.1
numpy 2.4.6
numpydoc 1.10.0
nvidia-nccl-cu12 2.29.7
odfpy 1.4.1
opencensus 0.11.3
opencensus-context 0.1.3
opencv-python 4.13.0
opencv-python-headless 4.13.0
openpyxl 3.1.5
opentelemetry-api 1.41.0
opentelemetry-exporter-prometheus 0.62b0
opentelemetry-proto 1.41.0
opentelemetry-sdk 1.41.0
opentelemetry-semantic-conventions 0.62b0
orjson 3.11.9
os-service-types 1.8.2
oslo.config 10.3.0
oslo.i18n 6.7.2
oslo.serialization 5.9.1
oslo.utils 10.0.1
overrides 7.7.0
packaging 26.0
palettable 3.3.3
pandas 2.3.3
pandocfilters 1.5.0
papermill 2.7.0
paramiko 4.0.0
parso 0.8.6
partd 1.4.2
pathspec 1.0.4
patsy 1.0.2
pbr 7.0.3
pexpect 4.9.0
pickleshare 0.7.5
pillow 12.2.0
pip 26.0.1
platformdirs 4.9.6
plotly 6.6.0
pluggy 1.6.0
ply 3.11
polars 1.44.1
prettytable 3.17.0
prometheus_client 0.25.0
prometheus_flask_exporter 0.23.2
prompt_toolkit 3.0.52
propcache 0.3.1
proto-plus 1.27.2
protobuf 6.33.5
psutil 7.2.2
ptyprocess 0.7.0
pure_eval 0.2.3
py-cpuinfo 9.0.0
py4j 0.10.9.9
pyarrow 23.0.1
pyasn1 0.6.3
pyasn1_modules 0.4.2
pybind11 3.0.3
pybind11-global 3.0.3
pycodestyle 2.12.1
pyconify 0.2.1
pycparser 2.22
pydantic 2.13.0
pydantic_core 2.46.0
pydantic-extra-types 2.11.2
pydantic-settings 2.14.0
pydeck 0.8.0b4
pydocstyle 6.3.0
pydot 4.0.1
pyflakes 3.2.0
PyGithub 2.9.0
Pygments 2.20.0
pyhdf 0.11.6
PyJWT 2.12.1
pylint 4.0.5
pylint-venv 3.0.4
pyls-spyder 0.4.0
pymatgen 2026.5.4
pymatgen-core 2026.8.13
pymc 6.0.1
pymdown-extensions 10.21.2
PyNaCl 1.6.2
pynndescent 0.5.13
pyocse 0.1.3
pyOpenSSL 26.0.0
pyparsing 3.3.2
pyproj 3.7.2
PyQt5 5.15.11
PyQt5_sip 12.17.0
PyQtWebEngine 5.15.7
PySide6 6.10.2
PySocks 1.7.1
pytensor 3.0.4
pytest 9.0.3
python-dateutil 2.9.0.post0
python-discovery 1.2.2
python-dotenv 1.2.2
python-json-logger 2.0.7
python-keystoneclient 5.8.0
python-lsp-black 2.0.0
python-lsp-jsonrpc 1.1.2
python-lsp-ruff 2.3.1
python-lsp-server 1.14.0
python-multipart 0.0.27
python-poppler 0.4.1
python-slugify 8.0.4
python-swiftclient 4.10.0
pytokens 0.4.1
pytoolconfig 1.2.5
pytz 2026.1.post1
pyu2f 0.1.5
pyuca 1.2
pyxdg 0.28
pyxtal 1.1.1
PyYAML 6.0.3
pyzmq 27.1.0
QDarkStyle 3.2.3
qstylizer 0.2.4
QtAwesome 1.4.2
qtconsole 5.7.2
QtPy 2.4.3
querystring_parser 1.2.4
ray 2.54.0
rdflib 7.6.0
redis 7.4.0
referencing 0.37.0
regex 2026.4.4
requests 2.33.1
retrying 1.4.2
rfc3339_validator 0.1.4
rfc3986 2.0.0
rfc3986-validator 0.1.1
rfc3987-syntax 1.1.0
rich 15.0.0
rich-toolkit 0.19.7
roman-numerals 4.1.0
rope 1.14.0
rpds-py 0.30.0
rsa 4.9.1
rtree 1.4.1
ruamel.yaml 0.19.1
ruff 0.15.10
s3cmd 2.4.0
s3transfer 0.16.0
scikit-image 0.26.0
scikit-learn 1.8.0
scipy 1.17.1
seaborn 0.13.2
SecretStorage 3.4.1
Send2Trash 2.1.0
setproctitle 1.2.2
setuptools 81.0.0
shellingham 1.5.4
shiboken6 6.10.2
simpervisor 1.0.0
sip 6.10.0
six 1.17.0
sklearn-compat 0.1.5
skops 0.13.0
smart_open 7.6.0
smmap 5.0.3
sniffio 1.3.1
snowballstemmer 3.0.1
sortedcontainers 2.4.0
soupsieve 2.8.3
sparse 0.18.0
spglib 2.7.0
Sphinx 9.1.0
sphinxcontrib-applehelp 2.0.0
sphinxcontrib-devhelp 2.0.0
sphinxcontrib-htmlhelp 2.1.0
sphinxcontrib-jsmath 1.0.1
sphinxcontrib-qthelp 2.0.0
sphinxcontrib-serializinghtml 1.1.10
spyder 6.1.4
spyder-kernels 3.1.4
SQLAlchemy 2.0.49
sqlparse 0.5.5
stack_data 0.6.3
starlette 1.0.0
statsmodels 0.14.6
stevedore 5.7.0
streamlit 1.56.0
superqt 0.8.0
sympy 1.14.0
tables 3.11.1
tabulate 0.10.0
tblib 3.2.2
tenacity 9.1.4
tensorboard 2.20.0
tensorboard_data_server 0.7.0
tensorboardX 2.6.2.2
terminado 0.18.1
text-unidecode 1.3
textdistance 4.6.3
threadpoolctl 3.6.0
three-merge 0.1.1
tifffile 2026.3.3
tinycss2 1.4.0
toml 0.10.2
tomli 2.4.1
tomlkit 0.14.0
toolz 1.1.0
tornado 6.5.5
tqdm 4.67.3
traitlets 5.14.3
typer 0.25.1
typing_extensions 4.15.0
typing-inspection 0.4.2
typing_utils 0.1.0
tzdata 2026.1
ujson 5.12.0
umap-learn 0.5.12
uncertainties 3.2.3
unicodedata2 17.0.1
uri-template 1.3.0
urllib3 2.6.3
uvicorn 0.44.0
uvloop 0.22.1
vasprun-xml 1.0.4
virtualenv 21.2.1
watchdog 6.0.0
watchfiles 1.1.1
wcwidth 0.6.0
webcolors 25.10.0
webencodings 0.5.1
websocket-client 1.9.0
websockets 16.0
Werkzeug 3.1.8
whatthepatch 1.0.7
wheel 0.46.3
widgetsnbextension 4.0.15
wrapt 2.1.2
wurlitzer 3.1.1
xarray 2026.4.0
xarray-einstats 0.10.0
xgboost 3.2.0
xlrd 2.0.2
xlwt 1.3.0
xmltodict 1.0.4
xyzservices 2026.3.0
yapf 0.43.0
yarl 1.23.0
zict 3.0.0
zipp 3.23.1

Jos huomaat, että jokin pakkaus puuttuu, voit usein asentaa sen itse komennolla pip install --user. Katso lisätietoja pakkausten omatoimisesta asentamisesta Python-dokumentaatiostamme.

On myös mahdollista käyttää Pythonin virtuaaliympäristöjä. Virtuaaliympäristön luomiseen käytä komentoa python3 -m venv --system-site-packages venv.

Jos mielestäsi jokin tärkeä pakkaus pitäisi sisällyttää CSC:n tarjoamaan moduuliin, ota yhteyttä asiakastukeemme. Huomaa, että joillakin koneoppimiskehyksillä on omat erilliset moduulinsa, esimerkiksi Roihussa: python-pytorch, python-vllm, python-tensorflow ja python-jax.

Huomio monisäikeisyydestä

python-data-moduulin lataaminen asettaa ympäristömuuttujan OMP_NUM_THREADS=1, mikä käytännössä poistaa OpenMP-monisäikeisyyden tuen käytöstä. Tämä on useimmissa tapauksissa järkevä asetus ja korjaa joitakin moniprosessiajoihin liittyviä ongelmia. Jos tiedät tarvitsevasi OpenMP-monisäikeisyyttä, aseta tämä muuttuja käsin, esimerkiksi Slurm-työskriptissäsi:

export OMP_NUM_THREADS=$SLURM_CPUS_PER_TASK

Lisenssi

Kaikki paketit on lisensoitu erilaisilla vapailla ja avoimen lähdekoodin lisensseillä (FOSS).

Käyttö

Käyttääksesi tätä ohjelmistoa Roihussa, alusta se komennolla:

module load python-data

käyttääksesi oletusversiota, tai jos haluat tietyn version (katso yllä saatavilla olevat versiot):

module load python-data/3.12-31.03

Jos haluat vain uusimman version tietyllä Python-versiolla, voit myös suorittaa:

module load python-data/3.12

Tämä näyttää kaikki saatavilla olevat versiot:

module avail python-data

Voit tarkistaa ladattuun moduuliin sisältyvät tarkat paketit ja versiot komennolla:

list-packages

Warning

Huomaa, että kirjautumissolmuja ei ole tarkoitettu raskaaseen laskentaan, joten käytä sen sijaan Slurm-eräajoja. Katso ohjeemme eräajojärjestelmän käytön aloittamiseen.

Tutustu myös CSC:n yleiseen Python-dokumentaatioon.

Paikallinen tallennustila

Roihun solmuissa on nopea paikallinen tallennustila, joka on hyödyllinen I/O-intensiivisille sovelluksille. Katso yleiset ohjeemme paikallisen väliaikaistallennustilan käytöstä Roihussa.