SAGA GIS

Saga GIS (System for Automated Geoscientific Analyses) on paikkatietosovellus spatiaalisen datan muokkaukseen ja paikkatietoanalyyseihin.

Saatavuus

SAGA GIS on saatavilla:

9.10.2 r-env-moduulissa SagaGIS R -pakettien kanssa, Roihussa
7.3.0 - qgis-moduulissa ilman SagaGIS R -paketteja, LUMIssa

Käyttö

Sitä voidaan käyttää graafisella käyttöliittymällä, komentorivityökaluilla tai R-paketin Rsagacmd tai RSAGA kautta. Koska RSAGA-pakettia ei enää aktiivisesti ylläpidetä eikä sitä ole testattu uudemmilla SAGA GIS -versioilla, suosittelemme käyttämään Rsagacmd-pakettia SAGA GIS -versioiden 7.9.0 ja sitä uudempien kanssa. Lisätietoja R-töiden ajamisesta tai RStudion käytöstä on r-env-dokumentaatiossa.

SagaGISin käyttöä varten jokin yllä luetelluista moduuleista täytyy ensin aktivoida; tarkista yksityiskohdat linkitetyiltä sivuilta.

SAGA GIS -komentorivikäyttöliittymä

SAGA GIS -komentorivityökaluja voidaan käyttää interaktiivisessa istunnossa tai eräajoissa.

SAGA GIS -komentorivikäyttöliittymä r-env-moduulilla

r-env on Apptainer-säiliö, mikä tarkoittaa, että komennot eroavat hieman tavallisista asennuksista: käytännössä kaikkien komentojen eteen täytyy lisätä apptainer_wrapper exec ennen tavallista komentoa.

Voit testata, että SAGA GIS latautui onnistuneesti, ja tulostaa komentorivityökalujen ohjetiedot komennolla

module load r-env
saga_cmd -h

SAGA GIS -komentorivikäyttöliittymä LUMIssa

LUMIn qgis-moduulilla SagaGIS-komentoja voidaan käyttää normaalisti, esimerkiksi:

module use /appl/local/csc/modulefiles
module load qgis
saga_cmd -h

SAGA GIS -graafinen käyttöliittymä

SAGA GIS -graafinen käyttöliittymä Roihussa

Käyttääksesi SAGA GISiä avaa se Roihun selainkäyttöliittymässä:

Kirjaudu Roihun selainkäyttöliittymään.
Avaa Desktop-sovellus.
Kun Desktop on käynnistetty, kaksoisnapsauta SAGA GIS -kuvaketta TAI avaa Terminal (Desktop-kuvake) ja käynnistä SAGA GIS:

module load r-env
saga_gui

SAGA GIS -graafinen käyttöliittymä LUMIssa

Käyttääksesi SAGA GISiä avaa se LUMIn selainkäyttöliittymässä:

Kirjaudu LUMIn selainkäyttöliittymään.
Avaa Desktop-sovellus.
Kun Desktop on käynnistetty, avaa uusin SAGA GIS -versio vasemman alakulman valikosta (kohdasta Other).
- Voit vetää ja pudottaa kuvakkeen työpöydällesi helpompaa käyttöä varten jatkossa

Jos haluat käyttää komentorivikäyttöliittymää Desktop-sovelluksessa, avaa Terminal Emulator vasemman alakulman valikosta ja lataa QGIS-moduuli:

module use /appl/local/csc/modulefiles
module load qgis
saga_gui
saga_cmd

Spatiaaliset aineistot CSC:n laskentaympäristössä

Roihussa on paikallisesti saatavilla satoja suomalaisia spatiaalisia aineistoja, lisäksi niitä on lisää Altaassa ja cPoudassa. Lisätietoja on sivulla Spatiaalinen data CSC:n laskentaympäristössä

Lisenssi

SAGA GIS on julkaistu GPL -lisenssillä.

Viittaus

Conrad, O., Bechtel, B., Bock, M., Dietrich, H., Fischer, E., Gerlitz, L., Wehberg, J., Wichmann, V., and Böhner, J. (2015): System for Automated Geoscientific Analyses (SAGA) v. 2.1.4, Geosci. Model Dev., 8, 1991-2007, doi:10.5194/gmd-8-1991-2015.

Kiitokset

Pyydämme mainitsemaan CSC:n ja Geoportin julkaisuissanne; tämä on tärkeää projektin jatkuvuuden ja rahoitusraportoinnin kannalta. Esimerkiksi voitte kirjoittaa: "The authors wish to thank CSC - IT Center for Science, Finland (urn:nbn:fi:research-infras-2016072531) and the Open Geospatial Information Infrastructure for Research (Geoportti, urn:nbn:fi:research-infras-2016072513) for computational resources and support".