SAGA GIS

Saga GIS (System for Automated Geoscientific Analyses) on paikkatietosovellus spatiaalisen datan muokkaukseen ja GIS-analyyseihin.

Saatavuus

SAGA GIS on saatavilla:

r-env-moduulina eri versioilla SagaGISin R-pakettien kanssa, vain Puhdissa
7.3.0 - qgis-moduulina ilman SagaGISin R-paketteja, Puhdissa ja LUMIssa

Käyttö

Sitä voidaan käyttää graafisella käyttöliittymällä, komentorivityökaluilla tai R-paketin Rsagacmd tai RSAGA kautta. Koska pakettia RSAGA ei enää aktiivisesti ylläpidetä eikä sitä ole testattu uudemmilla SAGA GIS -versioilla, suosittelemme käyttämään Rsagacmd-pakettia SAGA GIS -version 7.9.0 ja sitä uudempien versioiden kanssa. Lisätietoja R-töiden ajamisesta Puhdissa tai RStudion käytöstä löytyy r-env-dokumentaatiosta.

SagaGISin käyttöä varten jokin yllä luetelluista moduuleista täytyy ensin ottaa käyttöön; tarkista lisätiedot linkitetyiltä sivuilta.

SAGA GIS -komentorivikäyttöliittymä

SAGA GISin komentorivityökaluja voidaan käyttää interaktiivisessa istunnossa tai eräajoissa.

SAGA GIS -komentorivikäyttöliittymä r-env-moduulilla

r-env on Apptainer-säiliö, mikä tarkoittaa, että komennot eroavat hieman tavallisista asennuksista: käytännössä kaikkien komentojen eteen täytyy lisätä apptainer_wrapper exec ennen tavallista komentoa.

Voit testata, että SAGA GIS latautui onnistuneesti, ja tulostaa komentorivityökalujen ohjetiedot komennolla

apptainer_wrapper exec saga_cmd -h

SAGA GIS -komentorivikäyttöliittymä qgis-moduulilla

qgis-moduulilla SagaGIS-komentoja voidaan käyttää normaalisti, esimerkiksi:

saga_cmd -h

SAGA GIS -komentorivikäyttöliittymä LUMIssa

LUMIssa qgis-moduulilla SagaGIS-komentoja voidaan käyttää normaalisti, esimerkiksi:

module use /appl/local/csc/modulefiles
module load qgis
saga_cmd

SAGA GIS -graafinen käyttöliittymä

SAGA GIS -graafinen käyttöliittymä Puhdissa

Käyttääksesi SAGA GISiä avaa se Puhdin selainkäyttöliittymässä:

Kirjaudu Puhdin selainkäyttöliittymään.
Avaa Desktop-sovellus.
Kun Desktop on käynnistetty, kaksoisnapsauta SAGA GIS -kuvaketta TAI avaa Terminal (Desktop-kuvake) ja käynnistä SAGA GIS:

module load r-env
apptainer_wrapper exec saga_gui

SAGA GIS -graafinen käyttöliittymä LUMIssa

Käyttääksesi SAGA GISiä avaa se LUMIn selainkäyttöliittymässä:

Kirjaudu LUMIn selainkäyttöliittymään.
Avaa Desktop-sovellus.
Kun Desktop on käynnistetty, avaa uusin SAGA GIS -versio vasemman alakulman valikosta (kohdasta Other).
- Voit vetää ja pudottaa kuvakkeen työpöydällesi, jotta käyttö olisi jatkossa helpompaa

Jos haluat käyttää komentorivikäyttöliittymää Desktop-sovelluksessa, avaa Terminal Emulator vasemman alakulman valikosta ja lataa QGIS-moduuli:

module use /appl/local/csc/modulefiles
module load qgis
saga_gui
saga_cmd

Lisenssi

SAGA GIS on julkaistu GPL-lisenssillä.

Viittaus

Conrad, O., Bechtel, B., Bock, M., Dietrich, H., Fischer, E., Gerlitz, L., Wehberg, J., Wichmann, V., and Böhner, J. (2015): System for Automated Geoscientific Analyses (SAGA) v. 2.1.4, Geosci. Model Dev., 8, 1991-2007, doi:10.5194/gmd-8-1991-2015.

Kiitokset

Pyydämme mainitsemaan CSC:n ja Geoportin julkaisuissanne; tämä on tärkeää projektin jatkuvuuden ja rahoitusraportoinnin kannalta. Esimerkiksi voitte kirjoittaa: "The authors wish to thank CSC - IT Center for Science, Finland (urn:nbn:fi:research-infras-2016072531) and the Open Geospatial Information Infrastructure for Research (Geoportti, urn:nbn:fi:research-infras-2016072513) for computational resources and support".