SAGA GIS

Saga GIS (System for Automated Geoscientific Analyses) on GIS-sovellus paikkatiedon muokkaamiseen ja GIS-analyyseihin.

Saatavuus

SAGA GIS on saatavilla:

9.10.2 r-env-moduulissa, jossa on SagaGIS R -paketit, Roihussa
r-env-moduuli eri versioilla, jossa on SagaGIS R -paketit, vain Puhdissa
7.3.0 – qgis-moduulissa ilman SagaGIS R -paketteja, Puhdissa ja LUMIssa

Käyttö

Sitä voi käyttää graafisella käyttöliittymällä, komentorivityökaluilla tai R-paketin Rsagacmd tai RSAGA kautta. Koska RSAGA-pakettia ei enää aktiivisesti ylläpidetä eikä sitä ole testattu uudemmilla SAGA GIS -versioilla, suosittelemme käyttämään Rsagacmd-pakettia SAGA GIS -versioiden 7.9.0 ja sitä uudempien kanssa. Lisätietoja R-ajojen suorittamisesta tai RStudion käytöstä on r-env-dokumentaatiossa.

SagaGISin käyttöä varten jokin yllä luetelluista moduuleista täytyy ensin ottaa käyttöön; katso lisätiedot linkitetyiltä sivuilta.

SAGA GIS:n komentorivikäyttöliittymä

SAGA GIS:n komentorivityökaluja voi käyttää interaktiivisessa istunnossa tai eräajoissa.

SAGA GIS:n komentorivikäyttöliittymä r-env-moduulissa

r-env on Apptainer-säiliö, mikä tarkoittaa, että komennot eroavat hieman tavallisista asennuksista: käytännössä kaikkien komentojen eteen täytyy lisätä apptainer_wrapper exec ennen varsinaista komentoa.

Voit testata, että SAGA GIS latautui onnistuneesti, ja tulostaa komentorivityökalujen ohjetiedot komennolla

module load r-env

# In Roihu
saga_cmd -h

# In Puhti
apptainer_wrapper exec saga_cmd -h

SAGA GIS:n komentorivikäyttöliittymä LUMIssa

LUMIn qgis-moduulissa SagaGIS-komentoja voi käyttää normaalisti, esimerkiksi:

module use /appl/local/csc/modulefiles
module load qgis
saga_cmd -h

SAGA GIS:n graafinen käyttöliittymä

SAGA GIS:n graafinen käyttöliittymä Puhdissa

Käyttääksesi SAGA GISiä avaa se Puhdin selainkäyttöliittymässä:

Kirjaudu Puhdin selainkäyttöliittymään.
Avaa Desktop-sovellus.
Kun Desktop on käynnistynyt, kaksoisnapsauta SAGA GIS -kuvaketta TAI avaa Terminal (Desktop-kuvake) ja käynnistä SAGA GIS:

module load r-env

# In Roihu
saga_gui

# In Puhti
apptainer_wrapper exec saga_gui

SAGA GIS:n graafinen käyttöliittymä LUMIssa

Käyttääksesi SAGA GISiä avaa se LUMIn selainkäyttöliittymässä:

Kirjaudu LUMIn selainkäyttöliittymään.
Avaa Desktop-sovellus.
Kun Desktop on käynnistynyt, avaa uusin SAGA GIS -versio vasemman alakulman valikosta (kohdasta Other).
- Voit vetää ja pudottaa kuvakkeen työpöydällesi, jotta käyttö on jatkossa helpompaa

Jos haluat käyttää komentorivikäyttöliittymää Desktop-sovelluksessa, avaa Terminal Emulator vasemman alakulman valikosta ja lataa QGIS-moduuli:

module use /appl/local/csc/modulefiles
module load qgis
saga_gui
saga_cmd

Lisenssi

SAGA GIS on julkaistu GPL-lisenssillä.

Viittaus

Conrad, O., Bechtel, B., Bock, M., Dietrich, H., Fischer, E., Gerlitz, L., Wehberg, J., Wichmann, V., and Böhner, J. (2015): System for Automated Geoscientific Analyses (SAGA) v. 2.1.4, Geosci. Model Dev., 8, 1991-2007, doi:10.5194/gmd-8-1991-2015.

Kiitokset

Pyydämme mainitsemaan CSC:n ja Geoportin julkaisuissasi; tämä on tärkeää projektin jatkuvuuden ja rahoitusraportoinnin kannalta. Esimerkiksi voit kirjoittaa: "The authors wish to thank CSC - IT Center for Science, Finland (urn:nbn:fi:research-infras-2016072531) and the Open Geospatial Information Infrastructure for Research (Geoportti, urn:nbn:fi:research-infras-2016072513) for computational resources and support".