Sen2mosaic

Sen2mosaic on työkalu Sentinel-2 -datan lataamiseen, esikäsittelyyn ja mosaiikkien muodostamiseen.

Saatavuus

Sen2mosaic on saatavilla Puhdissa seuraavina versioina:

0.2

Riippuvuudet

sen2mosaic-moduuli riippuu geoconda/3.8.8- ja sen2cor/2.9-moduuleista, jotka ladataan automaattisesti.

Käyttö

Sen2mosaic sisältyy sen2mosaic-moduuliin, ja sen voi ladata komennolla

module load sen2mosaic

Puhdissa työkaluja käytetään seuraavasti:

s2m_download <arguments>
s2m_preprocess <arguments>
s2m_mosaic <arguments>

Lisätietoja kunkin työkalun käytettävissä olevista argumenteista saa näkyviin komennolla

s2m_mosaic --help

tai sen2mosaicin käyttöoppaasta. (Huomaa _ työkalujen nimissä Puhdissa!)

Komentojen s2m_preprocess ja s2m_mosaic kanssa voit käyttää argumenttia --n_processes asettaaksesi käytettävissä olevien CPU-ytimien määrän vastaamaan työsi laskentaytimien määrää.

Edistynyt käyttö

Komentoa s2m_preprocess voi määrittää tarkemmin L2A_GIPP.xml-tiedoston avulla (osa Sen2coria). Oletus-GIPP-tiedosto löytyy polusta /appl/soft/geo/sen2cor/2.9/Sen2Cor-02.09.00-Linux64/lib/python2.7/site-packages/sen2cor/cfg/L2A_GIPP.xml. Kopioi se $HOME-hakemistoosi, muokkaa sitä tarpeidesi mukaan ja lisää se komentoon: s2m_preprocess --gipp $HOME/L2A_GIPP.xml <other arguments>

Lisenssi

Sen2mosaic on julkaistu GNU,GPL v3 -lisenssillä.

Viittaus

Sen2mosaic ei tarjoa suositeltua viittaustietoa.

Samuel Bowers: Sen2mosaic v.0.2. https://github.com/smfm-project/sen2mosaic , last accessed on {date}.

Kiitokset

Pyydämme mainitsemaan CSC:n ja Geoportin julkaisuissanne; tämä on tärkeää projektin jatkuvuuden ja rahoitusraportoinnin kannalta. Voit kirjoittaa esimerkiksi: "The authors wish to thank CSC - IT Center for Science, Finland (urn:nbn:fi:research-infras-2016072531) and the Open Geospatial Information Infrastructure for Research (Geoportti, urn:nbn:fi:research-infras-2016072513) for computational resources and support".

Asennus

Lähes kaikki Sen2mosaicin riippuvuudet ovat saatavilla sen2cor- ja geoconda-moduuleista, joten Sen2mosaic asennettiin niiden päälle komennolla pip install --user opencv-python git+https://github.com/smfm-project/sen2mosaic.git, kun molemmat moduulit oli ladattu (muista asettaa ensin asennushakemisto komennolla export PYTHONUSERBASE=/path/to/sen2mosaic/install/directory. Lyhyempiä komentorivikutsuja varten luotiin komennot s2m_download, s2m_preprocess ja s2m_mosaic lyhentämään alkuperäisiä python3 /path/to/sen2mosaic/cli/download.py -komentoja. Tämä viimeinen vaihe ei ole käytettävyyden kannalta välttämätön.