Hyppää sisältöön

Puhdin ja Mahdin laskentapalvelut ovat poistuneet käytöstä. Puhdin ja Mahdin kirjautumisnoodit sekä tallennustila ovat saatavilla 15. lokakuuta 2026 asti, mutta ne eivät enää ole palvelusopimusten piirissä. Ryhdythän toimiin datan siirtämiseksi Roihuun välittömästi. Ohjeita löydät sivulta Roihun datan siirto-opas.

Suorituskykyiset kirjastot

Erilaisia suorituskykyisiä kirjastoja tiheään lineaarialgebraan, nopeisiin Fourier-muunnoksiin jne. on saatavilla moduulijärjestelmän kautta. Monet kirjastot ovat saatavilla sekä yksisäikeisinä että monisäikeisinä versioina; monisäikeiset moduulit on merkitty omp:lla moduuliversiossa. Puhtaille MPI-sovelluksille ja sovelluksille, jotka kutsuvat kirjastoja useista säikeistä, suositellaan yksisäikeisen kirjaston käyttöä.

Kirjastojen saatavuus voi riippua ladatusta kääntäjäkokonaisuudesta ja MPI-ympäristöstä; käytä komentoa module avail selvittääksesi saatavilla olevat kirjastot. Katso kirjaston dokumentaatiosta ohjeet siihen linkittämiseen. Huomaa, että useimmat moduulit asettavat LIBRARY_PATH- ja LD_LIBRARY_PATH-ympäristömuuttujat, joten linkkerin -llibrary-valitsin on usein riittävä. Useimmat moduulit asettavat myös <library>_INSTALL_ROOT-ympäristömuuttujat, joita voidaan hyödyntää mukautetuissa käännöskomentosarjoissa. Esimerkiksi fftw-kirjastoa voidaan käyttää seuraavasti:

module load fftw
<compiler_command> -o myprog myprog.o -lfftw3

ja hakemisto, joka sisältää include-, lib- jne. hakemistot, löytyy FFTW_INSTALL_ROOT-ympäristömuuttujan kautta.

Kirjastot Roihu-CPU:ssa

Valikoituja Roihu-CPU:ssa saatavilla olevia kirjastoja:

  • Tiheä lineaarialgebra: openblas, amdblis
  • Hajautettu tiheä lineaarialgebra: netlib-scalapack
  • Nopeat Fourier-muunnokset: fftw

Kirjastot Roihu-GPU:ssa

Valikoituja Roihu-GPU:ssa saatavilla olevia kirjastoja:

  • Grace-suorittimelle:
  • Tiheä lineaarialgebra: nvhpc (sisältää NVPL:n), openblas, netlib-lapack
  • Hajautettu tiheä lineaarialgebra: nvhpc (sisältää NVPL:n), netlib-scalapack
  • Nopeat Fourier-muunnokset: nvhpc (sisältää NVPL:n), fftw
  • Hopper-GPU:lle:
  • CUDA (cuda/nvhpc-moduuli) sisältää kirjastoja kuten cublas, cufft, cusolver, ...

Kirjastot Puhdissa

Valikoituja Puhdissa saatavilla olevia kirjastoja:

  • Tiheä lineaarialgebra: intel-oneapi-mkl
  • Hajautettu tiheä lineaarialgebra: intel-oneapi-mkl, netlib-scalapack
  • Nopeat Fourier-muunnokset: fftw

Kirjastot Mahdissa

Valikoituja Mahdissa saatavilla olevia kirjastoja:

  • Tiheä lineaarialgebra: openblas, amdblis, amdlibflame
  • Hajautettu tiheä lineaarialgebra: netlib-scalapack, amdscalapack
  • Nopeat Fourier-muunnokset: fftw

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta