Hyppää sisältöön

Welcome to our weekly research support coffee hour on Zoom! Click here for more information.

Warning!

Puhti scratch disk is becoming very full (80+ % ) resulting in performance degradation. Everybody is advised to only keep actively processed data on scratch, all other data should be deleted, transferred to host institute or stored in Lumi-O. No new quota will be granted. Click here for a tool for examining your disk usage.

Eräajon lähettäminen

Lähetä ajo jonoon komennolla sbatch:

sbatch <batch_job_file>

Esimerkiksi:

sbatch job.sh

Kun ajo on lähetetty onnistuneesti, komento tulostaa lähetetyn ajon tunnistenumeron. Esimerkiksi Submitted batch job 3609650.

Voit tarkistaa, että ajosi on käynnissä oikein, seuraavasti:

squeue -u $USER

tai

squeue --me

Päätteessä pitäisi näkyä ajosi tunniste ja muita tietoja.

Lähetetyn eräajon voi perua komennolla:

scancel <jobid>

Esimerkiksi

scancel 3609650

Saat lisätietoja ajoistasi komennolla:

sacct

Tiedot sisältävät ajojen tilan (PENDING, RUNNING, COMPLETED, FAILED jne.) sekä ajon tunnisteen. Oletuksena sacct-komento näyttää tiedot käyttäjän omista ajoista, jotka on lähetetty jonoon kuluvana päivänä. Komennolla on myös laaja valikoima valintoja ja parametreja, joilla voidaan määrittää, mitä tietoja näytetään. Katso kaikki sacct-valinnat ja -parametrit.

Vältä hakemasta liikaa dataa komennolla sacct

Älä hae ajodataa pitkältä aikaväliltä komennolla sacct. sacct hakee tietonsa Slurmin kirjanpitotietokannasta, ja suurilla hauilla toiminto voi kuormittaa järjestelmää merkittävästi. Vältä erityisesti ajamasta komentoa monta kertaa peräkkäin. Sen sijaan voit ohjata tulosteen tiedostoon ja etsiä siitä haluamasi analysoitavat tiedot. Esimerkiksi voit tallentaa viimeisten 7 päivän datan tiedostoon sacct-output.txt:

sacct --starttime now-7days > sacct-output.txt

Lisätietoja

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta