Hyppää sisältöön

Welcome to our weekly research support coffee hour on Zoom! Click here for more information.

Warning!

Puhti scratch disk is becoming very full (80+ % ) resulting in performance degradation. Everybody is advised to only keep actively processed data on scratch, all other data should be deleted, transferred to host institute or stored in Lumi-O. No new quota will be granted. Click here for a tool for examining your disk usage.

Selainkäyttöliittymät Puhdille ja Mahdille

Johdanto

Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymiä osoitteissa www.puhti.csc.fi ja www.mahti.csc.fi voidaan käyttää supertietokoneiden käyttämiseen pelkällä verkkoselaimella. Selainkäyttöliittymä on saatavilla myös LUMI:lle osoitteessa www.lumi.csc.fi, katso lisätietoja LUMI-dokumentaatiosta.

Huomaa, että kirjautuminen Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymiin edellyttää monivaiheista tunnistautumista. Lisätietoja Yhdistäminen-sivulla.

Laajuus

HPC:n selainkäyttöliittymät soveltuvat parhaiten interaktiivisiin työkuormiin, jotka kuluttavat kohtuullisen määrän laskentaresursseja. Esimerkkejä ovat datan esi- ja jälkikäsittely Jupyter Notebookeissa käyttäen enintään muutamia kymmeniä CPU-ytimiä, pienimuotoiset AI/ML-kokeilut käyttäen yhtä GPU:ta sekä datan visualisointitehtävät. Tämän vuoksi interaktiivisten töiden enimmäiskesto on rajoitettu 16 tuntiin.

Huomaa, että selainkäyttöliittymien interaktiiviset sovellukset eivät sovellu monisolmuisiin eivätkä moni-GPU-töihin. Tällaiset työkuormat kannattaa tehdä tavallisina eräajoina. Jos eräajot ja HPC-ympäristön komentorivikäyttö ovat sinulle uusia, suosittelemme CSC Computing Environment -itseopiskelumateriaaleja, jotta opit hyödyntämään CSC:n supertietokoneita mahdollisimman tehokkaasti.

Saatavilla olevat ominaisuudet

  • Ominaisuudet, jotka ovat saatavilla sekä Puhdin että Mahdin selainkäyttöliittymissä:
    • Tarkastele, lataa omalle koneelle, lataa palveluun ja siirrä tiedostoja Altaan, supertietokoneen ja oman tietokoneesi välillä
    • Avaa komentotulkki kirjautumissolmulla
    • Avaa pysyvämpi komentotulkki laskentasolmulla
    • Tarkastele käynnissä olevia eräajoja
    • Tarkastele levykiintiöitä ja projektin tilaa
    • Käynnistä interaktiivisia sovelluksia ja yhdistä niihin suoraan selaimesta:
      • Työpöytä sovelluksilla kuten Maestro ja VMD
      • Julia-Jupyter
      • Jupyter
      • Jupyter kursseille: interaktiivinen Jupyter-istunto erityisesti kursseja varten
      • MATLAB
      • MLflow
      • RStudio
      • TensorBoard
      • Visual Studio Code
  • Vain Puhdissa saatavilla olevat sovellukset:
    • Kiihdytetty visualisointi sovelluksilla:
      • Blender
      • COMSOL
      • ParaView
      • VMD
  • Vain Mahdissa saatavilla olevat sovellukset:
    • R-Jupyter

Komentotulkki

Komentotulkki-sovelluksilla voidaan käyttää supertietokoneen komentoriviä selainkäyttöliittymän kautta. Voit avata joko yhteyden kirjautumissolmuille tai pysyvämmän komentotulkin laskentasolmuille. Lisätietoja on Komentotulkki -sivulla.

Tiedostoselain

Tiedostot-sovelluksella voit hallita tiedostojasi supertietokoneella ja käyttää tallennuspalveluja, kuten Allasta ja IDAa. Lisätietoja on sivulla Tiedostot ja tallennuspalvelut.

Aktiiviset työt

Viimeisimmät ja käynnissä olevat eräajot voidaan tarkastella yläreunan navigointipalkin Jobs-osiosta valitsemalla Active jobs. Täällä voit nähdä töidesi nykyisen tilan ja millaisia resursseja niille on pyydetty. Käynnissä olevan työn poistaminen peruuttaa työn.

Tulevaisuudessa eräajojen lähettäminen selainkäyttöliittymän kautta saattaa tulla mahdolliseksi, mutta toistaiseksi suositeltu tapa käynnistää tavallisia eräajoja on käyttää komentotulkissa komentoa sbatch.

Projektinäkymä

Yläreunan navigointipalkin Tools-osion alta löytyvän Project view -näkymän avulla voit tarkastella supertietokoneiden nykyisiä levy- ja projektikohtaisia laskutusyksiköt (BUs) -kiintiöitä. Lisätietoja on sivulla Projektinäkymä.

File Deletion Explorer (beta)

File Deletion Explorer on beta-vaiheessa oleva työkalu, jota voidaan käyttää Puhdissa scratch-alueen siivouksen poistoluetteloiden tarkasteluun. Katso lisätietoja sivulta Puhdin ja Mahdin scratch-levyjen datan hallinta.

Interaktiiviset sovellukset

Interaktiiviset sovellukset ovat ohjelmia, jotka voidaan käynnistää ja ajaa laskentasolmuilla ja jotka tarjoavat graafisen käyttöliittymän. Tällaisia sovelluksia ovat esimerkiksi Jupyter Notebook, RStudio ja Visual Studio Code. Täydellinen sovellusluettelo ja sovelluskohtaiset ohjeet löytyvät sivulta Interaktiiviset sovellukset.

Info-label

Jos interaktiivinen sovellus ei käynnisty tai ei toimi odotetusti, voit poistaa istunnon ja yrittää käynnistää sovelluksen uudelleen. Katso myös Vianmääritys.

Osiot ja resurssit

Warning-label

Vain muutamat Puhdin ja Mahdin osiot ovat käytettävissä selainkäyttöliittymissä. Joissakin sovelluksissa käytettävissä olevien osioiden joukko on myös rajallisempi kuin toisissa.
Selainkäyttöliittymien töiden enimmäiskesto on 16 tuntia, jotta interaktiivisten resurssien jonotusajat pysyvät lyhyinä. Jos työsi vaatii tätä pidempiä ajoja, suosittelemme ajamaan ohjelmistosi eräajoina.

Puhdin selainkäyttöliittymässä ovat käytettävissä osiot interactive, small, test, gpu ja gputest. gpu- tai gputest-osion valitseminen varaa yhden Nvidia V100 GPU:n. Yleisiä tietoja Puhdin jonoista on sivulla Puhdin osiot.

Mahdin selainkäyttöliittymässä ovat käytettävissä osiot interactive, small ja gpusmall. gpusmall-osion valitseminen varaa jaetun Nvidia A100 GPU:n (a100_1g.5g), jonka laskentakapasiteetti on 1/7 täydestä A100:sta. Lisätietoja Mahdin jaetuista GPU:ista on sivulla Mahdin osiot.

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta