Hyppää sisältöön

Docs CSC now features an automatic Finnish translation. Click here for more information.

Warning!

Puhti and Mahti will be decommissioned after Roihu becomes available. Users should clean up unnecessary files and move any required data by the end of August 2026. See the Roihu data preparation instructions for details.

Puhti scratch is very full: keep only active data there and move or delete everything else. No new Puhti scratch quota will be granted.

MIRA

MIRA on kokogenomin shotgun- ja EST-sekvenssien kokoaja. Nykyinen versio pystyy tekemään aitoja hybridisiä de novo -kokoonpanoja NGS-sekvensointiteknologialla tuotetuista luvuista.

Lisenssi

Vapaasti käytettävissä ja avointa lähdekoodia GNU GPLv2 -lisenssillä.

Saatavuus

  • Puhti: 5rc1

Käyttö

MIRA otetaan käyttöön komennolla:

module load mira/5rc1

Sen jälkeen voit käyttää MIRA-komentoja:

mira
mirabait
miraconvert
miramem

Lisätietoja

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta

Ymmärrän.