Sovellukset

PyTorchin ja TensorFlown CPU-versiot saatavilla Roihussa, 3.9.2026

Kaikkien asennettujen PyTorchin ja TensorFlown versioiden CPU-versiot on nyt tuotu saataville Roihussa. Tällä tuetaan paremmin interaktiivista käyttöä ja hybridityövuoita.

PyTorch 2.13.0 saatavilla Roihu-GPU:ssa, 31.8.2026

PyTorch 2.13.0 on nyt saatavilla Roihu-GPU:ssa python-pytorch -moduulissa. Se on asetettu oletusversioksi.

R 4.6.1 r-env:ssä, 18.8.2026

R-versio 4.6.1 on nyt saatavilla r-env:ssä Roihussa, ja se on asetettu oletusversioksi.

CSC:n kemiaohjelmistopino LUMIssa päivitetty, 23.3.2026

CSC:n LUMIssa ylläpitämä kemiaohjelmistopino (/appl/local/csc/soft/chem) on käännetty uudelleen hiljattaisen suuren LUMI-päivityksen jälkeen. Seuraavien ohjelmistojen moduulit ja ohjeet on päivitetty:

Samalla eräitä vanhempia moduuliversioita on poistettu käytöstä. Yleisesti ottaen suosittelemme käyttämään uusimpia ohjelmistoversioita, sillä niiden suorituskyky on yleensä parempi ja niissä on vähemmän virheitä kuin vanhemmissa julkaisuissa.

Ota yhteyttä CSC:n asiakastukeen, jos huomaat ongelmia moduuleissa.

Schrödinger Maestro 2026.1, 12.3.2026

Schrödinger Maestro versio 2026.1 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

Geoconda 3.14.3, 5.3.2026

Geocondasta on lisätty uusi versio Puhtiin ja Mahtiin. Tässä versiossa on lisätty poikkeuksellisen paljon uusia Python-kirjastoja, mutta myös useita (ylläpitämättömiä) kirjastoja on poistettu. Katso kaikki tiedot geoconda -sivulta.

R 4.5.2 r-env:ssä, 17.2.2026

R-versio 4.5.2 on nyt saatavilla r-env:ssä Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusversioksi.

PyTorch 2.9.1 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 9.1.2026

PyTorch 2.9.1 on nyt saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusversioksi. Se sisältää uusimmat versiot suosituista paketeista, kuten Hugging Face transformers, vLLM ja FAISS. Apex on poistettu, koska kirjasto on ollut poistettuna käytöstä jo pitkään. Uusia kirjastoja ovat litgpt, ultralytics, sahi ja torchgeo. Katso lisätietoja PyTorch-moduulin dokumentaatiostamme.

CSC:n ArcGIS-konsortio suomalaisille yliopistoille päättyy 31.12.2025

CSC järjesti yli 20 vuoden ajan ArcGIS-konsortiota suomalaisille yliopistoille ja tarjosi lisenssejä ArcGIS-ohjelmistoon, ESRI Virtual Campukseen sekä Suomen katu- ja tieaineistoihin. Konsortio ja pääsy lisensoituihin tuotteisiin päättyvät 31.12.2025. Vuodesta 2026 alkaen yliopistojen tulee ostaa ESRI/ArcGIS-lisenssinsä suoraan ESRI Finlandilta.

GROMACS 2025.4, 9.12.2025

GROMACS 2025.4 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet kaikkien uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

AMS 2025 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 27.11.2025

AMS on päivitetty versioon 2025.105 sekä Mahdissa että Puhdissa, ja asetettu oletusmoduuliksi. AMS2025:n julkaisutiedotteissa on yhteenveto tärkeimmistä muutoksista ja parannuksista.

Schrödinger Maestro 2025.4, 13.11.2025

Schrödinger Maestro versio 2025.4 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

HADDOCK3 saatavilla LUMIssa, 12.9.2025

Uusin versio HADDOCK3:sta, joka soveltuu laajamittaiseen ligandi/proteiini/vasta-aine -telakointiin ja integroivaan mallinnukseen, on saatavilla LUMIssa, mukaan lukien esimerkkieräajot.

Python Data 3.12-25.09 nyt oletusversio, 12.9.2025

Uusi versio Python Datasta python-data/3.12-25.09 on asennettu, ja siinä on uusimmat versiot suosituista data-analytiikkapaketeista. Se on myös asetettu oletusversioksi.

GROMACS 2025.2, 13.8.2025

GROMACS 2025.2 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet kaikkien uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

Schrödinger Maestro 2025.3, 7.8.2025

Schrödinger Maestro versio 2025.3 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

CP2K 2025.1 saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa, 6.8.2025

CP2K 2025.1 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien, korjausten ja rikkovien muutosten luetteloa varten.

R 4.5.1 r-env:ssä, 22.7.2025

R-versio 4.5.1 on nyt saatavilla r-env:ssä Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusversioksi.

PyTorch 2.7.1 saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa, 8.7.2025

PyTorch 2.7.1 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa, ja se on asetettu oletusversioksi. Se sisältää uusimmat versiot suosituista paketeista, kuten Hugging Face transformers, vLLM ja FAISS. SGLang on nyt saatavilla vain Mahdissa. Katso lisätietoja PyTorch-moduulin dokumentaatiostamme .

Schrödinger Maestro 2025.2, 15.5.2025

Schrödinger Maestro versio 2025.2 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

GROMACS 2025.1, 7.5.2025

GROMACS 2025.1 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet kaikkien uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

Geoconda 3.12.10, 6.5.2025

geoconda versio 3.12.10 on lisätty ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa. Pakettipäivitysten lisäksi se sisältää useita uusia paketteja: access, contectily, dask-image, duckdb, esda, geocube, geodatasets, geoplot, h3-py, jupyter-resource-usage, pandana, pyrosm, pysheds, rio-cogeo ja urbanaccess. Edellisessä geocondassa saatavilla olleista paketeista wrf-python ja xarray_leaflet eivät valitettavasti tällä kertaa olleet lisättävissä.

PyTorch 2.6.0 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 10.4.2025

PyTorch 2.6.0 on nyt saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusversioksi. Se sisältää uusimmat versiot suosituista paketeista, kuten Hugging Face transformers, vLLM ja FAISS. PyTorch geometric ja siihen liittyvät paketit eivät enää sisälly moduuliin, koska ne eivät tue PyTorchin uudempia versioita. Katso lisätietoja PyTorch-moduulin dokumentaatiostamme.

R Mahdissa, 7.4.2025

R on nyt saatavilla myös Mahdissa, mukaan lukien RStudio Mahdin selainkäyttöliittymässä. r-env -moduuli Mahdissa toimii samankaltaisesti kuin r-env Puhdissa, ja siinä on tällä hetkellä R-versio 4.4.2. Mahdin uusi pieni partitio soveltuu monenlaiseen R- ja RStudio-työskentelyyn, pois lukien kaikkein muistintensiivisimmät tehtävät. Puhtiin tottuneiden käyttäjien kannattaa huomata, että Mahdissa ei ole erillistä muistivarausta, ja ainoa tapa saada lisää muistia on varata enemmän ytimiä.

Tykky 0.4.2, 27.2.2025

Uusin Tykyn versio (0.4.2) on asennettu ja asetettu oletusversioksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso Tykyn julkaisut -sivulta, mitä uutta on tullut.

R 4.4.2 r-env:ssä, 25.2.2025

R-versio 4.4.2 on nyt saatavilla r-env:ssä Puhdissa, ja se on asetettu oletusversioksi. Uusi versio tulee pian saataville myös RStudioon Puhtin selainkäyttöliittymässä.

JAX 0.4.38 saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa, 0.5.0 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 19.02.2025

JAX 0.4.38 on nyt asennettu Puhtiin, Mahtiin ja LUMIin. Se on asetettu oletusversioksi LUMIssa.

Lisäksi JAX 0.5.0 on asennettu Puhtiin ja Mahtiin ja asetettu siellä oletusversioksi. Tälle JAX-versiolle ei tällä hetkellä ole ROCm-tukea, eikä sitä ole asennettu LUMIin. JAX 0.5.0 sisältää rikkovia muutoksia. Jos koodisi ei ole yhteensopiva, voit harkita sen päivittämistä tai palata versioon 0.4.38.

LUMIssa 0.4.38-moduuli korjaa muistiallokoinnin epävakauksia, joita esiintyi versiossa 0.4.30.

Snakemake- ja Nextflow-oppaat parannettu merkittävästi

Työvuotyökaluille on saatavilla oppaita, joihin on tehty merkittäviä päivityksiä: Snakemake ja Nextflow. Oppaissa kuvataan eri vaihtoehtoja työkalujen asentamiseen ja ajamiseen. Huomaa myös uusi Antoni Gołośin pro gradu -tutkielma, jossa vertaillaan automatisoituja työvuolähestymistapoja supertietokoneilla.

Schrödinger Maestro 2025.1, 6.2.2025

Schrödinger Maestro versio 2025.1 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

Molpro 2024.3 on saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 3.2.2025

Molpro on päivitetty versioon 2024.3. Aiemmin vain Puhdissa saatavilla ollut uusin versio on nyt myös Mahdissa. Katso Viimeaikaiset muutokset, josta löydät tiedot uusista ominaisuuksista, virheenkorjauksista ja parannuksista.

PyTorch 2.5.1 saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa, 20.12.2024

PyTorch 2.5.1 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Kaikki tavalliset paketit sisältyvät siihen. LUMIn moduulissa on nyt kokeellinen FAISS-tuki. Katso lisätietoja PyTorch-moduulin dokumentaatiostamme.

Maestro-versiot, jotka ovat vanhempia kuin 2023.1, eivät toimi 13.3.2025 jälkeen

Schrödinger on ottanut käyttöön uuden lisenssinhallinnan, joka ei tue Maestro -versioita, jotka ovat vanhempia kuin 2023.1. Tämän seurauksena CSC ei enää pysty tarjoamaan lisenssiä Maestro-versioille 2022.4 ja sitä vanhemmille 13. maaliskuuta 2025 jälkeen. Jos et ole vielä tehnyt niin, siirry käyttämään versioita 2023.1 tai uudempia mahdollisimman pian! Katso lisätietoja Maestro-sivultamme paikallisen Maestro-asennuksesi lisensoinnin määrittämisestä.

GROMACS 2024.4, 7.11.2024

GROMACS 2024.4 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet kaikkien uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

Schrödinger Maestro 2024.4, 5.11.2024

Schrödinger Maestro versio 2024.4 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

JAX 0.4.30 saatavilla LUMIssa, 23.10.2024

JAX 0.4.30 on nyt asennettu LUMIin ja asetettu oletusversioksi sen jälkeen, kun se oli aiemmin tuotu saataville Puhdissa ja Mahdissa. Asennus LUMIin hyödyntää nyt uusia AMD-ajureita ja ROCM 6.0.3:a, jotka asennettiin LUMIn järjestelmäpäivityksen yhteydessä syyskuussa.

transformers-paketti ei enää sisälly moduuliin, koska se tukee virallisesti vain JAX-versioon 0.4.13 asti.

Tästä versiosta alkaen JAXista on saatavilla "small"- ja "full"- versiot, joissa "full"-versio sisältää JAX ML -ekosysteemin paketit kuten aiemmin, kun taas "small"-versio sisältää vain JAXin GPU-tuella sekä Tensorflown ja PyTorchin vain CPU:lle tarkoitetut versiot niiden datan lataus- ja käsittelyapuohjelmia varten, mutta ei muita lisäpaketteja. Voit käyttää jälkimmäistä, jos haluat puhtaamman pohjan lisäpakettien asentamiseen.

NAMD 3.0 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 11.10.2024

NAMD 3.0 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso tästä luettelo uusista ja parannetuista ominaisuuksista. Erityisesti GPU-suorituskyky on parantunut merkittävästi verrattuna NAMD 2.14:ään. Suurimittaisiin GPU-simulaatioihin suosittelemme kuitenkin NAMD3:n ajamista LUMI-G:ssä, koska GPU-resursseja on siellä paremmin saatavilla kuin Puhdissa ja Mahdissa. Katso eräajoesimerkit täältä.

Amber24 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 8.10.2024

Amber versio 24 (mukaan lukien AmberTools24) on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso tästä luettelo tärkeimmistä uusista ominaisuuksista.

CSC:n kemiaohjelmistopino LUMIssa päivitetty, 26.9.2024

CSC:n LUMIssa ylläpitämä kemiaohjelmistopino (/appl/local/csc/soft/chem) on käännetty uudelleen hiljattaisen suuren LUMI-päivityksen jälkeen. Seuraavien ohjelmistojen moduulit ja ohjeet on päivitetty:

Samalla joitakin vanhoja moduuliversioita on poistettu käytöstä. Yleisesti ottaen suosittelemme käyttämään uusimpia ohjelmistoversioita, sillä niiden suorituskyky on yleensä parempi ja niissä on vähemmän virheitä kuin vanhemmissa julkaisuissa.

PyTorch 2.4.1 saatavilla LUMIssa, 19.9.2024

PyTorch 2.4.1 ROCm 6.1:llä on nyt saatavilla LUMIssa. LUMIn PyTorch- moduuli sisältää nyt vLLM-version 0.5.5 FlashAttention-2:n, bitsandbytesin ja monien muiden usein pyydettyjen pakettien lisäksi, jotka sisältyivät jo aiempiin asennuksiin. Katso lisätietoja PyTorch-moduulin dokumentaatiostamme.

GROMACS 2024.3, 12.9.2024

GROMACS 2024.3 on nyt saatavilla Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet kaikkien uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

JAX 0.4.30 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 5.9.2024

JAX 0.4.30 on asennettu Puhdissa ja Mahdissa ja asetettu oletusversioksi.

transformers-paketti ei enää sisälly moduuliin, koska se tukee virallisesti vain JAX-versioon 0.4.13 asti.

Tästä versiosta alkaen JAXista on saatavilla "small"- ja "full"-versiot, joissa "full"-versio sisältää JAX ML -ekosysteemin paketit kuten aiemmin, kun taas "small"-versio sisältää vain JAXin GPU-tuella sekä Tensorflown ja PyTorchin vain CPU:lle tarkoitetut versiot niiden datan lataus- ja käsittelyapuohjelmia varten, mutta ei muita lisäpaketteja. Voit käyttää jälkimmäistä, jos haluat puhtaamman pohjan lisäpakettien asentamiseen.

LUMI-asennus viivästyy alkusyksyyn meneillään olevan järjestelmäpäivityksen ja siihen liittyvien järjestelmäajuriversioiden muutosten vuoksi.

CP2K 2024.2 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 27.8.2024

CP2K 2024.2 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien, korjausten ja rikkovien muutosten luetteloa varten.

ORCA 6.0.0, 22.8.2024

ORCA 6.0.0 on nyt saatavilla Puhdissa ja Mahdissa. Tämä merkittävä julkaisu tuo mukanaan lukuisia uusia ominaisuuksia ja parannuksia. Täydet tiedot löytyvät ORCA 6 Changes -sivulta.

PyTorch 2.4.0, 21.8.2024

PyTorch 2.4.0 on lisätty Puhtiin ja Mahtiin. LUMI-asennus viivästyy nykyisen käyttökatkon jälkeiseen aikaan. torchtext-paketti ei enää sisälly moduuliin, koska se on poistettu käytöstä eikä enää toimi PyTorch 2.4:n kanssa. Katso lisätietoja PyTorch- moduulin dokumentaatiostamme.

AMS 2024 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 20.8.2024

AMS on päivitetty versioon 2024.102 sekä Mahdissa että Puhdissa ja asetettu oletusmoduuliksi. AMS2024:n julkaisutiedotteissa on yhteenveto tärkeimmistä muutoksista ja parannuksista AMS2023:n jälkeen.

Geoconda 3.11.9, 7.8.2024

geoconda versio 3.11.9 on lisätty ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Pakettipäivitysten lisäksi se sisältää muutamia uusia paketteja: geo2ml, h3pandas, openeo, pcraster ja r5py. Edellisessä geocondassa saatavilla olleista paketeista copc-lib ja osmnx eivät valitettavasti tällä kertaa olleet lisättävissä.

Schrödinger Maestro 2024.3, 5.8.2024

Schrödinger Maestro versio 2024.3 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Merkittävänä uutuutena tämä julkaisu sisältää uuden OPLS5-polarisoituvan voimakentän. Katso julkaisutiedotteet täydellinen luettelo uusista ominaisuuksista ja parannuksista.

PyTorch 2.3.1, 13.6.2024

PyTorch 2.3.1 on lisätty Puhtiin ja Mahtiin. LUMI-asennus viivästyy alkusyksyyn yhteensopimattoman ROCm-ajuriversion vuoksi. Tässä versiossa on myös päivitetty tapa, jolla Python-komennot kääritään, koska tämä ratkaisee useita ongelmia virtuaaliympäristöjen ja Jupyter Notebookien käytössä. Tämän vuoksi apptainer- ja apptainer_wrapper-komennot eivät enää toimi, mutta muuten muutoksen pitäisi olla käyttäjille näkymätön. Katso lisätietoja PyTorch- moduulin dokumentaatiostamme.

Python Data 3.10-24.04 nyt oletusversio

Hiljattain asennettu python-data/3.10-24.04 on asetettu Python Datan oletusversioksi.

R 4.4.0 r-env:ssä, 7.6.2024

R-versio 4.4.0 on nyt saatavilla r-env:ssä Puhdissa, ja se on asetettu oletusversioksi. Uusi versio tulee pian saataville myös RStudioon Puhtin selainkäyttöliittymässä.

Molpro 2024.1 on saatavilla Puhdissa, 5.6.2024

Uusi Molpro 2024.1 sisältää uusia ominaisuuksia, kuten icMRCCSD:n CAS(2,2)-version. Katso Viimeaikaiset muutokset, josta löydät yksityiskohtaisen luettelon uusista ominaisuuksista, virheenkorjauksista ja parannuksista.

GROMACS 2024.2, 22.5.2024

GROMACS 2024.2 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. LUMIn uudet GPU-versiot on käännetty käyttämään AdaptiveCpp:n instant submission -tilaa, mikä voi joissakin tapauksissa parantaa suorituskykyä ja skaalautuvuutta yli 10 %. Katso julkaisutiedotteet kaikkien uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

Schrödinger Maestro 2024.2, 3.5.2024

Schrödinger Maestro versio 2024.2 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

AMS 2023 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 21.3.2024

AMS on päivitetty versioon 2023.104 sekä Mahdissa että Puhdissa ja asetettu oletusmoduuliksi. Vastaava AMS-GUI on myös päivitetty.

GROMACS 2024.1, 21.3.2024

GROMACS 2024.1 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

CP2K 2024.1 saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa, 20.3.2024

CP2K 2024.1 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien, korjausten ja rikkovien muutosten luetteloa varten. Merkittävänä muutoksena laskennat keskeytyvät nyt varoituksen antamisen sijaan, jos SCF-sykli ei konvergoi. Lisää IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE-avainsana &SCF- osioon ottaaksesi vanhan toiminnan käyttöön.

NAMD 3.0b6 saatavilla LUMIssa, 12.3.2024

Uusin AMD GPU -tuettu NAMD-versio on nyt saatavilla esiasennettuna LUMIssa. Katso NAMD-sivultamme eräajoesimerkkejä ja suorituskykyhuomioita sekä NAMD-verkkosivustolta luettelo uusista ominaisuuksista, jotka parantavat yhden solmun moni-GPU-simulaatioiden suorituskykyä.

JAX 0.4.23, 6.3.2024

JAX 0.4.23 lisättiin Puhtiin, Mahtiin ja LUMIin. JAX-moduulit sisältävät nyt myös vain CPU:lle tarkoitetun PyTorch-asennuksen, jota käytetään joskus yhdessä JAXin kanssa sen datan latausominaisuuksien vuoksi, sekä asiaankuuluvat päivitykset kaikkiin Python-paketteihin, jotka sisältyivät jo aiempiin JAX-moduuleihin.

PyTorch 2.2.1, 1.3.2024

PyTorch 2.2.1 lisättiin Puhtiin, Mahtiin ja LUMIin. LUMIn moduuli sisältää ROCm-versiot FlashAttention-2:sta ja bitsandbytesista, koska nämä ovat käyttäjille vaikeita lisätä itse. xFormers on lisätty kaikkiin kolmeen järjestelmään kaikkien aiemmin tuettujen pakettien (esim. DeepSpeed ja Transformers) uusien versioiden lisäksi.

Snakemake, 23.2.2024

Snakemake-työvuotyökalulle tarkoitettu sovellussivu on lisätty Docs CSC:hen. Katso sieltä lisätietoja Snakemaken tehokkaasta käytöstä Puhdissa.

GROMACS 2024.0, 16.2.2024

GROMACS 2024.0 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten. Erityisesti LUMIn GPU-tuettu moduuli käyttää nyt uudempaa ROCm:n (5.6.1) ja AdaptiveCPP:n (23.10.0) versiota, mikä parantaa suorituskykyä.

TmoleX 2024, 9.2.2024

TmoleX on päivitetty, ja se on nyt saatavilla myös selainkäyttöliittymän kautta Puhdissa.

TURBOMOLE 7.8, 8.2.2024

TURBOMOLE versio 7.8 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

Schrödinger Maestro 2024.1, 8.2.2024

Schrödinger Maestro versio 2024.1 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

ORCA 5.0.4, 7.2.2024

ORCA 5.0.4 on nyt saatavilla Puhdissa ja Mahdissa. Se on virheenkorjausjulkaisu, joka sisältää korjauksia D4-toteutuksen virheeseen. Huomaa muutos siinä, miten se käynnistetään eräajokomennossa.

R 4.3.2 r-env:ssä, 2.2.2024

R-versio 4.3.2 on nyt saatavilla r-env:ssä ja se on asetettu oletusversioksi. Uusi versio tulee pian saataville myös RStudioon Puhtin selainkäyttöliittymässä.

COSMO-RS, 30.1.2024

COSMO-RS on uusi työkalu nestevaiheen ominaisuuksien mallintamiseen, ja se perustuu kvanttikemiasta johdettuihin ominaisuuksiin. Se koostuu BIOVIA COSMOsuite -työkalupakista, ja sitä voidaan käyttää yhdessä TURBOMOLEn kanssa.

Python Data 3.10-23.11, 28.11.2023

Uusi versio Python Datasta python-data/3.10-23.11 on asennettu, ja siinä on uusimmat versiot suosituista data-analytiikkapaketeista.

Gromacs 2023.3, 17.11.2023

Gromacs 2023.3 on nyt saatavilla Puhdissa, Mahdissa ja LUMIssa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten. Gromacs-moduulien nimeämistä LUMIssa on myös muutettu, koska hipSYCL on vaihtanut nimensä muotoon AdaptiveCpp. Tästä eteenpäin LUMIn GPU-tuettujen moduulien perään lisätään yksinkertaisesti -gpu sekaannusten välttämiseksi.

PyTorch 2.1 ja TensorFlow 2.14, 13.11.2023

PyTorch 2.1 ja TensorFlow 2.14 ovat nyt saatavilla Puhdissa ja Mahdissa. Katso PyTorch 2.1 -blogikirjoitus tai TensorFlow 2.14:n julkaisutiedotteet.

Schrödinger Maestro 2023.4, 10.11.2023

Schrödinger Maestro versio 2023.4 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet luettelo uusista ominaisuuksista ja parannuksista.

Molpro 2023.2 on saatavilla Puhdissa, 31.10.2023

Uusi Molpro 2023.2 sisältää uusia ominaisuuksia, kuten rajoittamattoman coupled clusterin ja PQS-geometriaoptimoijan. Katso Viimeaikaiset muutokset yksityiskohtaista uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

AlphaFoldin geneettiset tietokannat saatavilla Puhdissa, 20.10.2023

AlphaFold 2.3.2-1:n geneettiset tietokannat ovat nyt saatavilla Puhdissa. Katso lisätietoja AlphaFoldin sovellussivulta.

Schrödinger Maestro 2023.3, 8.9.2023

Schrödinger Maestro versio 2023.3 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

CP2K 2023.2 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 1.9.2023

CP2K 2023.2 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Julkaisutiedotteet ja lisätiedot versiosta löytyvät katso CP2K:n verkkosivustolta.

CSD 2023.2 saatavilla Puhdissa, 22.8.2023

CSD-ohjelmistokokonaisuuden (Cambridge Structural Database) versio 2023.2 (mukaan lukien GOLD) on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa. Katso julkaisutiedotteet täältä.

Gromacs 2023.2 saatavilla Puhdissa ja Mahdissa, 21.8.2023

Gromacs 2023.2 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet täältä.

Gromacs 2023.2 ja CP2K 2023.2 saatavilla LUMIssa, 4.8.2023

Gromacsin 2023.2:n ja CP2K:n 2023.2:n CPU- ja GPU-versiot on asennettu LUMIin. Julkaisutiedotteet ja lisätiedot versiosta löytyvät GROMACS-käsikirjasta ja CP2K:n verkkosivustolta.

R 4.3.0 r-env:ssä, 20.6.2023

R-versio 4.3.0 on nyt saatavilla r-env:ssä ja se on asetettu oletusversioksi. Uusi versio tulee pian saataville myös RStudioon Puhtin selainkäyttöliittymässä.

Gromacs 2023.1 saatavilla LUMIssa, 7.6.2023

Gromacs 2023.1:n CPU- ja GPU-versiot on asennettu LUMIin. Erityisesti GPU-tuettu moduuli on virallinen hipSYCL-versio, jonka suorituskyky on parantunut merkittävästi aiempiin julkaisuihin verrattuna. LUMI-G-ohjeet Gromacsin sovellussivulla on myös päivitetty, ja sisäänrakennettua multidir-ominaisuutta hyödyntävää monisimulaatioiden ajo-opasta on laajennettu ja mukautettu LUMI-G:tä varten.

R 4.2.2 r-env:ssä, 26.5.2023

R-versio 4.2.2 on nyt saatavilla r-env:ssä ja se on asetettu oletusversioksi. Uusi versio tulee pian saataville myös RStudioon Puhtin selainkäyttöliittymässä.

Schrödinger Maestro 2023.2, 25.5.2023

Schrödinger Maestro versio 2023.2 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.

NoMachine ei ole enää saatavilla CSC:n supertietokoneilla, 9.5.2023

NoMachine-etätyöpöytäpalvelu lopetetaan 25. toukokuuta 2023 nykyisen lisenssikauden päättyessä. Palvelun korvaavat selainkäyttöliittymät CSC:n supertietokoneilla. Ensimmäinen niistä, Puhtin selainkäyttöliittymä, on saanut tutkijoilta hyvän vastaanoton, käyttäjämäärä kasvaa edelleen nopeasti ja se kattaa nyt 36 % kaikista käyttäjistä. Vastaavat selainkäyttöliittymät avataan myös Mahdille ja LUMIlle lähitulevaisuudessa. Korvaavista ratkaisuista tietyissä käyttötapauksissa katso sovellusten poistokäytäntösivulta.

Gromacs ja CP2K nyt saatavilla LUMIssa, 19.4.2023

Gromacsin ja CP2K:n CPU- ja GPU-tuetut versiot on asennettu LUMIin. Ennen moduulien lataamista ota ensin CSC:n moduulipuu käyttöön komennolla module use /appl/local/csc/modulefiles. Huomaa, että GPU-tuettu Gromacs-versio on AMD:n ohjelmistosta tekemä epävirallinen HIPifioitu haara, eikä alkuperäiset kehittäjät tue sitä.

PyTorch 2.0 ja TensorFlow 2.12, 27.3.2023

PyTorch 2.0 ja TensorFlow 2.12 ovat nyt saatavilla Puhdissa ja Mahdissa. Katso PyTorch 2.0 -blogikirjoitus tai TensorFlow 2.12:n julkaisutiedotteet.

Turbomole 7.7, 3.3.2023

Turbomole 7.7 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet täältä.

Schrödinger Maestro 2023.1 ja moduulien poistokäytäntö, 10.2.2023

Uusin versio Schrödinger Maestrosta (v2023.1) on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi CSC:n supertietokoneilla. Katso julkaisutiedotteet uusien ominaisuuksien ja parannusten luetteloa varten.
Tästä eteenpäin Maestro-moduuleihin CSC:n supertietokoneilla sovelletaan kahden vuoden siivoussykliä. Käytännössä yli kaksi vuotta vanhat moduuliversiot poistetaan levytilan vapauttamiseksi ja uusimpien versioiden käytön edistämiseksi, sillä ne ovat yleensä suorituskykyisempiä ja niissä on vähemmän virheitä.

CSC:n ohjelmistokokoelma LUMIssa, 31.1.2023

CSC:n LUMI-supertietokoneelle esiasentamia sovelluksia voi nyt tarkastella saatavuuden mukaan ryhmitellystä sovellusluettelosta. Kattava luettelo henkilökohtaisiin tai projektikohtaisiin asennuksiin saatavilla olevista EasyBuild-resepteistä löytyy LUMI Software Librarysta.

CP2K 2023.1, 30.1.2023

CP2K 2023.1 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet täältä.

Gromacs 2022.4, 16.1.2023

Gromacs 2022.4 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet täältä.

Materials Studion ja Discovery Studion lisenssi ei ole enää saatavilla, 3.1.2023

CSC:n tarjoamat kansalliset Materials Studion ja Discovery Studion lisenssit päättyivät vuoden 2022 lopussa. Harkitse niiden sijaan esimerkiksi Maestron tai AMS:n käyttöä.

sbatch-hq, 19.12.2022

HyperQueuelle tarkoitettu kääre sbatch-hq on luotu mahdollistamaan helppo ja tehokas tehtäväviljely, eli suuren läpimenon laskennan työvuot, joissa tarkoituksena on ajaa monia samankaltaisia (ei-MPI-rinnakkaisia, riippumattomia) komentoja/ohjelmia. Katso HyperQueue-sivulta lisätietoja.

PyTorch 1.13, 9.12.2022

PyTorch 1.13.0 on nyt saatavilla pytorch/1.13-moduulissa Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusversioksi. Katso PyTorch 1.13:n julkaisuun liittyvä blogikirjoitus sekä CSC:n PyTorch-moduulin dokumentaatio.

Amber22 asennettu Puhtiin, 16.11.2022

Amber versio 22 on asennettu Puhtiin ja asetettu oletusmoduuliksi. Katso tästä luettelo tärkeimmistä uusista ominaisuuksista.

Maestro 2022.3 ja 2022.4 asennettu Puhtiin, 15.11.2022

Schrödinger Maestro 2022.3 ja 2022.4 on asennettu Puhtiin, ja jälkimmäinen versio on asetettu oletusmoduuliksi. Katso julkaisutiedotteet täältä.

CP2K 2022.2, 10.11.2022

CP2K 2022.2 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet täältä.

Gromacs 2022.3, 7.11.2022

Gromacs 2022.3 on asennettu ja asetettu oletusmoduuliksi Puhdissa ja Mahdissa. Katso julkaisutiedotteet täältä.

Ohjelmistojen asentaminen Spackilla, 28.10.2022

Käyttäjät voivat nyt asentaa ohjelmistoja CSC:n supertietokoneille Spack-paketinhallinnan avulla. Katso täältä lyhyt opas käyttäjän Spack-moduulin käyttöön CSC:llä.

Pakettien asentaminen Biocondasta Tykyn avulla, 10.10.2022

Uusi opas pakettien asentamisesta Bioconda- kanavasta Tykky-konttikääretyökalun avulla on julkaistu. Tämä opas esittelee suositellun tavan asentaa ohjelmistopaketteja, jotka liittyvät bioinformatiikkaan ja biolääketieteelliseen tutkimukseen. Huomaa, että CSC on poistanut käytöstä Conda-asennusten suoran (ei-kontitetun) käytön supertietokoneillamme tiedostojärjestelmän suorituskykyongelmien vuoksi.

Saatavilla olevia sovelluksia voi nyt tarkastella myös lisenssityypin mukaan ryhmiteltyinä, 7.10.2022

Aakkosjärjestyksen sekä tieteenalan tai saatavuuden mukaan ryhmittelyn lisäksi sovelluksia voi nyt tarkastella myös lisenssityypin mukaan ryhmiteltyinä. Kustakin lisenssiluokasta annetaan jonkin verran tietoa. Katso Sovellukset lisenssin mukaan. (Sivulle pääsee myös sivunavigaation kautta: Applications > By license)

Python Data 3.10-22.09, 7.10.2022

Puhtin Red Hat 8 -päivityksen yhteydessä uusi Python Data -moduuli on asennettu (sekä Puhtiin että Mahtiin). Lisäksi vanhat conda-pohjaiset moduulit on poistettu, ja moduulien nimeäminen on muuttunut. Moduulit nimetään nyt Python- version (PV) sekä asennuksen vuoden (YY) ja kuukauden (MM) mukaan muodossa PV-YY.MM. Tyypillisesti moduuli sisältää asennushetkellä uusimmat kirjastoversiot siinä määrin kuin ohjelmistoriippuvuudet sallivat. Moduuleja voi myös ladata pelkän Python-version perusteella, jolloin saat uusimman kyseisen Python-version asennuksen, esimerkiksi: module load python-data/3.9.

`r-env-singularity` nimetty uudelleen `r-env`:ksi ja päivitetty R 4.2.1:een RHEL8-päivityksen yhteydessä, 14.9.2022

Puhtin RHEL8-päivityksen jälkeen r-env-singularity-moduuli on nimetty uudelleen r-env:ksi. R-versio on päivitetty versioon 4.2.1 yhdessä useiden muiden moduuliin sisältyvien asennusten versiopäivitysten kanssa. Koska RHEL8-päivitys vaati muutoksia r-env-moduulin asetuksiin, vanhemmat R-versiot eivät ole tällä hetkellä saatavilla.

Discovery Studion ja Material Studion lisenssi päättyy vuonna 2023, 25.8.2022

CSC on tarjonnut kansallisen akateemisen lisenssin Discovery Studiolle ja Materials Studiolle. Vähäisen käytön ja päällekkäisten työkalujen (Maestro) saatavuuden vuoksi lisenssiä ei jatketa tämän vuoden jälkeen. Tämä tarkoittaa, että vuonna 2023 näitä molekyylimallinnustyökaluja ei voi enää käyttää CSC:llä eikä käyttäjien omilla tietokoneilla. Ota yhteyttä asiakastukeen, jos tarvitset apua molekyylimallinnustyösi siirtämisessä muihin mallinnusympäristöihin.

PyTorch 1.12, 8.7.2022

PyTorch 1.12.0 on nyt saatavilla pytorch/1.12-moduulissa Puhdissa ja Mahdissa. Katso viralliset PyTorch 1.12:n julkaisutiedotteet sekä CSC:n PyTorch-moduulin dokumentaatio.

CP2K-moduulit Mahdissa käännetty uudelleen, 5.7.2022

OpenBLASiin liittyvän ongelman vuoksi CP2K-moduulit Mahdissa on käännetty uudelleen ja linkitetty toiseen lineaarialgebrakirjastoon (AMD BLIS). Vanhat versiot käyttivät joissakin tapauksissa jopa seitsemän kertaa enemmän muistia kuin aiemmin, eivätkä matriisidiagonalisoinnit hyötyneet ELPA-kirjastosta odotetulla tavalla.

Python Data 3.9-3 ja RAPIDS 22.04, 5.5.2022

Uudet versiot Python Datasta ja RAPIDSista ovat nyt saatavilla sekä Puhdissa että Mahdissa. Oletusversiot on muutettu näihin uusiin versioihin.

CP2K 9.1 linkitetty Gromacsiin 2022, 19.4.2022

CP2K 9.1 on linkitetty Gromacsiin 2022 QM/MM:ää varten moduulissa gromacs-env/2022-cp2k Mahdissa. Tämä vaihtoehto oli aiemmin saatavilla CP2K-moduulissa cp2k/8.1-gmx, joka on nyt poistettu käytöstä. Käytä jatkossa gromacs-env/2022-cp2k-moduulia QM/MM-simulaatioihin.

PyTorch 1.11, 8.4.2022

PyTorch 1.11.0 on nyt saatavilla pytorch/1.11-moduulissa Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusmoduuliksi. Katso viralliset PyTorch 1.11:n julkaisutiedotteet sekä CSC:n PyTorch- moduulin dokumentaatio.

LUE julkaistu Puhdissa, 5.4.2022

Likimääräinen työkalu nimeltä LUE (Lustre Usage Explorer) kansioissa olevan datan määrän raportointiin on julkaistu Puhdissa. LUE on huomattavasti nopeampi kuin tavalliset työkalut kuten stat tai du, ja samalla se kuormittaa tiedostojärjestelmää vähemmän. Käytä LUE:ta seurataksesi, kuinka paljon dataa/tiedostoja sinulla on levyllä, ja tee siivouksia ajoissa varmistaaksesi paremman suorituskyvyn tiedostojärjestelmälle kaikille käyttäjille.

Tykky 0.2.2, 31.3.2022

Tykky, aivan uusi työkalu Conda/pip-ympäristöjen käärimiseen Singularity-kontin sisään, on julkaistu. Kontitus parantaa huomattavasti käynnistysaikoja ja vähentää IO-kuormaa, kun jaetussa rinnakkaistiedostojärjestelmässä on vähemmän tiedostoja. Suosittelemme käärimään kaikki olemassa olevat Conda-ympäristöt kontteihin Tykyn avulla, koska Condan suora käyttö CSC:n supertietokoneilla on poistettu käytöstä.

TensorFlow 2.8, 17.3.2022

TensorFlow 2.8.0 on nyt saatavilla tensorflow/2.8-moduulissa Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusmoduuliksi. Katso TensorFlow 2.8:n julkaisutiedotteet GitHubissa lisätietoja varten.

Gromacs 2022, 9.3.2022

Gromacs 2022 on asennettu Puhtiin ja Mahtiin, ja se on saatavilla molemmissa järjestelmissä komennolla module load gromacs-env/2022. Luettelo uusista ominaisuuksista ja muutoksista löytyy Gromacsin käsikirjasta. gromacs-env/2021 on nyt oletusversio.

CP2K 9.1, 4.3.2022

CP2K versio 9.1 on asennettu Mahtiin, ja se on saatavilla komennolla module load cp2k/9.1-omp, kunhan gcc/10.3.0 ja openmpi/4.1.0 on ensin ladattu. Luettelo uusista ominaisuuksista ja muutoksista löytyy CP2K:n verkkosivustolta.

Schrödinger Maestro 2022.1, 25.2.2022

Schrödinger Maestro 2022.1 on asennettu Puhtiin ja asetettu oletusmoduuliksi. Luettelo uusista ominaisuuksista löytyy Schrödingerin verkkosivustolta.

Gromacs 2021 nyt oletusversio, 7.2.2022

Gromacs 2021.5 on asennettu Puhtiin ja Mahtiin ja asetettu oletusmoduuliksi (gromacs-env).

Condan suora käyttö poistettu käytöstä, 4.2.2022

CSC on poistanut Conda-asennusten suoran käytön käytöstä supertietokoneidemme (Puhti ja Mahti) jaetuissa tiedostojärjestelmissä.

Python Data 3.9-2, 20.1.2022

Uusi versio Python Datasta on nyt saatavilla komennolla module load python-data/3.9-2 sekä Puhdissa että Mahdissa. Se sisältää uusimmat versiot Scikit-learnista, SciPysta, Pandasista, JupyterLabista ja monista muista suosituista data-analytiikan ja koneoppimisen opas -paketeista Python 3.9:lle.

Python Datan oletusmoduuli käyttää nyt Singularitya, 26.11.2021

python-data-moduulin oletusversio on muutettu versioon 3.9-1. Tämä tarkoittaa, että jos olet aiemmin käyttänyt vain komentoa module load python-data, saat nyt tämän uuden version automaattisesti. Tämä versio on asennettu Singularityn avulla, minkä pitäisi nopeuttaa latausaikoja huomattavasti. Kääreskriptien ansiosta tämän muutoksen pitäisi olla käyttäjille enimmäkseen näkymätön. Jos kohtaat silti ongelmia, älä epäröi ilmoittaa niistä CSC:n asiakastukeen.

Schrödinger Maestro 2021.4, 24.11.2021

Schrödinger Maestro 2021.4 on asennettu Puhtiin ja asetettu oletusmoduuliksi.

PyTorch 1.10, 10.11.2021

PyTorch 1.10.0 on nyt saatavilla pytorch/1.10-moduulissa Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusmoduuliksi. Katso viralliset PyTorch 1.10:n julkaisutiedotteet lisätietoja varten. CSC:n moduulissa on seuraavat parannukset:

Jupyter Lab toimii nyt (aiemmin toimi vain tavallinen Jupyter Notebook -käyttöliittymä)
Sisäänrakennettu DeepSpeed -tuki (kokeellinen tuki)

TensorFlow 2.7, 9.11.2021

TensorFlow 2.7.0 on nyt saatavilla tensorflow/2.7-moduulissa Puhdissa ja Mahdissa, ja se on asetettu oletusmoduuliksi. Katso TensorFlow 2.7:n julkaisutiedotteet GitHubissa lisätietoja varten. CSC:n moduulissa on seuraavat parannukset:

Jupyter Lab toimii nyt (aiemmin toimi vain tavallinen Jupyter Notebook -käyttöliittymä)

Schrödinger Maestro 2021.3, 30.8.2021

Schrödinger Maestro 2021.3 on asennettu Puhtiin ja asetettu oletusmoduuliksi. Laajennettuihin Maestro-ohjeisiin on lisätty osio siitä, miten Quantum Espresso -ajoja voi nopeuttaa. Myös skriptissä ollut virhe, joka luo schrodinger.hosts-tiedoston, on korjattu asettamalla parallel HOST -merkintä käyttämään large-Slurm-partitiota tarkoitetulla tavalla.

Turbomole 7.5.1, 25.8.2021

Turbomole 7.5.1 on nyt saatavilla ja oletusmoduuli Puhdissa. Tärkein muutos tässä versiossa on se, että toisen kertaluvun approksimoituja coupled cluster -laskentoja suorittava ricc2-moduuli toimii asianmukaisesti, kun taas Puhtin vanhemmissa versioissa on hiljattain raportoitu numeerisia epävakauksia. Nämä ongelmat eivät koske Mahdissa asennettua TM v7.5:tä.

CP2K 8.2, 13.8.2021

CP2K versio 8.2 on asennettu Mahtiin, ja se on saatavilla komennolla module load cp2k/8.2-omp. Tämä edellyttää, että gcc/10.3.0 ja openmpi/4.1.0 on ensin ladattu. Versio 7.1-elpa säilyy toistaiseksi oletusmoduulina, mutta se vaihdetaan lähitulevaisuudessa versioon 8.2-omp (nimestä huolimatta ELPA-diagonalisointikirjasto on linkitetty myös uuteen 8.2-versioon). Version 8.2-omp cp2k.psmp- binääri on testattu, ja se on suunnilleen yhtä tehokas kuin 7.1-elpa.

Luettelo uusista ominaisuuksista ja muutoksista löytyy CP2K:n verkkosivustolta. Huomaa, että jotkin avainsanat, kuten MAP_CONSISTENT QS-osiossa, on poistettu käytöstä.

AMS 2021.102, 13.8.2021

AMS on päivitetty versioon 2021.102 sekä Mahdissa että Puhdissa ja asetettu oletusmoduuliksi. AMS- dokumentaatio on päivitetty vastaavasti kattamaan version 2021.102.

Molpro 2021.2, 10.8.2021

Molpro 2021.2 on nyt saatavilla ja oletusversio Puhdissa. Luettelo viimeaikaisista muutoksista on saatavilla Molpron verkkosivustolla. Molpro-sivullamme on myös uutta tietoa skaalautuvuudesta ja esimerkki NVMe:n käytöstä.

PyTorch 1.9, 2.7.2021

PyTorch 1.9.0 on nyt saatavilla pytorch/1.9-moduulissa Puhdissa ja Mahdissa. Moduuli sisältää myös uusimmat versiot TorchVisionista, TorchAudiosta ja TorchTextistä. Katso viralliset julkaisutiedotteet lisätietoja varten.

Python Data 3.9, 22.6.2021

Uusi versio Python Datasta on nyt saatavilla komennolla module load python-data/3.9-1 Puhdissa. Se sisältää uusimmat versiot Scikit-learnista, Pandasista, JupyterLabista ja monista muista suosituista data-analytiikan ja koneoppimisen opas -paketeista Python 3.9:lle.

Tämä on Python Datan ensimmäinen versio, joka on asennettu Singularityn avulla, minkä pitäisi nopeuttaa latausaikoja huomattavasti. Kääreskriptien ansiosta tämän muutoksen pitäisi olla käyttäjille enimmäkseen näkymätön. Jos kohtaat silti ongelmia, älä epäröi ilmoittaa niistä CSC:n asiakastukeen.