-
Laskentaympäristö
Laskentaympäristö
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuihin 32 ja 16, 25.2.2026
- Jupyter R-ytimellä on nyt saatavilla Mahdissa.
- VSCode päivitetty versioon 1.111.0.
- MLflow-sovellus tukee nyt uudempia MLflow-versioita.
- Mahdin Compute node shell -sovelluksen ytimien enimmäismäärä on nostettu 12:een.
- Open OnDemand päivitetty versioon 4.0.10.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuihin 31 ja 15, 3.12.2025
- File Deletion Explorer -työkalu vie nyt tiedot oikein, kun käytössä on useita projekteja (Puhti).
- MATLABin oletusmuisti on nostettu 8 gigatavuun (Mahti).
- Open OnDemand päivitetty versioon 4.0.8 (Mahti).
Puhdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 30, 5.11.2025
- Uusi File Deletion Explorer -työkalu on lisätty testattavaksi, katso lisätietoja täältä.
- MATLABin oletusmuisti on nostettu 8 gigatavuun.
- Allas Swift -integraatio tuottaa nyt oikeat tallennus-URL-osoitteet.
- Open OnDemand päivitetty versioon 4.0.8.
Ohjeita datan siirtämiseen CSC:n supertietokoneiden välillä parannettu, 30.10.2025
Olemme parantaneet ohjeitamme datan siirtämisestä suoraan CSC:n supertietokoneiden välillä käyttäen työkaluja kuten scp ja rsync. Erityisesti nyt, kun SSH-avaimet vaaditaan todennukseen CSC:n supertietokoneilla, olemme lisänneet ohjeet siihen, miten SSH-agentin välitys otetaan käyttöön Linuxissa/macOS:ssä ja Windowsissa. Tämä on vaatimus, jotta CSC:n supertietokoneiden välille voidaan muodostaa suora yhteys esimerkiksi datan tehokasta siirtämistä varten.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 29 ja 14, 2.10.2025
- CPU-, GPU-, tallennus- ja pilvilaskutusyksiköt (BUs) näkyvät nyt selainkäyttöliittymissä.
- Kirjautumistapa ei enää oletusarvoisesti ole Haka-kirjautuminen, vaan sen voi valita vapaasti.
- MATLAB on lisätty Mahtiin, mutta se vaatii lisenssin.
- MATLAB-version valinta on lisätty Puhtiin.
- MATLAB Puhdissa sallii nyt muiden kuin CSC:n lisenssien käytön MathWorks-tililtäsi.
- VSCode päivitetty versioon 1.104.1.
- TurboVNC päivitetty versioon 3.2 Desktop-sovelluksessa.
- Rclone päivitetty versioon 1.71.1
- Open OnDemand päivitetty versioon 4.0.7.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 28 ja 13, 19.8.2025
- Rclone päivitetty versioon 1.70.3
- TensorBoard odottaa nyt, että se on käynnistynyt täysin ennen kuin käyttäjä voi muodostaa yhteyden.
- Desktop-sovellus käyttää nyt
module reset-komentoamodule restore-komennon sijaan. - Joitakin tietoturva- ja suorituskykyparannuksia on tehty.
- Open OnDemand päivitetty versioon 4.0.6.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 26 ja 12, 6.5.2025
- Selainkäyttöliittymien työiden enimmäiskesto on nyt rajoitettu 16 tuntiin jonotusaikojen parantamiseksi.
- VSCode asettaa nyt
python.defaultInterpreterPath-asetuksen, jotta oikean Python-tulkin tunnistaminen helpottuu. - Jupyter-sovelluksen virtuaaliympäristöt toimivat nyt paremmin joidenkin moduulien, kuten geocondan, kanssa.
- Sähköposti istunnon käynnistyessä -vaihtoehto on lisätty kaikkiin interaktiivisiin sovelluksiin.
- Open OnDemand päivitetty versioon 4.0.3.
Uusi datan siivouskäytäntö Puhdissa, 17.4.2025
Puhdissa on käytössä prosessi vanhojen, aktiivisessa käytössä olemattomien scratch-tiedostojen siivoamiseen (poistamiseen). Jotta järjestelmä pysyy käyttökelpoisena, muutamme siivouskäytäntöä.
Uusi käytäntö on:
- Jos projektin scratch-kiintiö on 5 TiB tai enemmän, siivous kohdistuu tiedostoihin, joita ei ole käytetty (avattu, luettu, muokattu) viimeisen 90 päivän aikana.
- Muissa projekteissa, joiden scratch-kiintiö on pienempi, siivouskäytäntö pysyy ennallaan. Siivous kohdistuu tiedostoihin, joita ei ole käytetty (avattu, luettu, muokattu) viimeisen 180 päivän aikana.
Voit käyttää komentoa csc-workspaces nähdäksesi, minkä siivousjakson piirissä
projektisi ovat.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 25 ja 11, 7.4.2025
- Mahti: RStudio on lisätty.
- RStudio hakee nyt saatavilla olevan r-env-version dynaamisesti.
- VSCode päivitetty versioon 1.98.2.
- Python-moduulin valinta on lisätty VSCodeen.
- Interaktiivisten sovellusten käynnistysasetukset voidaan nyt tallentaa ja palauttaa myöhemmin. Katso Tallennetut interaktiivisten sovellusten asetukset, miten niitä käytetään.
- Interaktiivisten sovellusten lomakkeiden otsikoita ja kuvauksia on parannettu.
- Interaktiivisten sovellusten paikallisen levyn oletusmäärää on pienennetty.
- Selainkäyttöliittymien suorituskykyä on parannettu.
- Open OnDemand päivitetty versioon 4.0.2.
22.4.2025 alkaen monivaiheinen tunnistautuminen vaaditaan kirjautumiseen Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymiin, 2.4.2025
Muutos: 22.4.2025 alkaen monivaiheinen tunnistautuminen (MFA) vaaditaan kirjautumiseen Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymiin.
Toimenpide: Testaa, onko MFA jo käytössä kotiorganisaatiosi Haka-kirjautumisissa. Käytä MyCSC:n testisivua (valitse Haka MFA). On erittäin suositeltavaa käyttää kotiorganisaatiosi Haka MFA:ta, jos mahdollista. Jos Haka MFA ei ole käytössä tai jos kotiorganisaatiosi ei tarjoa Hakaa, aktivoi CSC MFA näiden ohjeiden mukaisesti.
Perustelu: Tällä muutoksella parannamme laskenta-, data- ja pilvipalveluidemme tietoturvaa. Lue lisää MFA:sta research.csc.fi-sivuston blogista.
Ota yhteyttä CSC Service Deskiin, jos sinulla on kysymyksiä tai tarvitset tukea MFA:n käyttöönotossa.
14.4.2025 alkaen SSH-kirjautuminen Puhtiin ja Mahtiin toimii vain MyCSC:hen lisätyillä SSH-avaimilla, 25.3.2025
Muutos: 14.4.2025 alkaen vain MyCSC:n kautta lisätyt SSH-avaimet
mahdollistavat kirjautumisen Puhtiin tai Mahtiin SSH:lla. Perinteinen salasanaan perustuva
todennus ja henkilökohtaiseen ~/.ssh/authorized_keys-tiedostoosi tallennetut SSH-avaimet
eivät enää toimi. Huomaa, että tämä muutos ei vaikuta Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymiin,
ja kirjautumisistuntoja voidaan käynnistää verkkoselaimessa kuten ennenkin.
Toimenpide: Jotta voit käyttää Puhdin ja Mahdin kirjautumissolmuja SSH:lla, sinun on luotava SSH-avaimet ja lisättävä julkinen avaimesi MyCSC:hen. Katso täältä yksityiskohtaiset ohjeet SSH-avainten käyttöönottoon ja käyttöön.
Perustelu: Tämän muutoksen tarkoituksena on parantaa laskenta-, data- ja pilvipalveluidemme tietoturvaa. Salasanaan perustuvat kirjautumiset ovat haavoittuvia, samoin käsin hallinnoidut SSH-avaimet. MyCSC:n avainhallinnan käyttöönotto vahvistaa merkittävästi käyttäjän identiteetin varmistamista.
Ota yhteyttä CSC Service Deskiin, jos sinulla on kysymyksiä tai tarvitset tukea SSH-avainten käyttöönotossa.
Uusi pieni osio korkean suorituskyvyn NVMe-tallennuksella Mahdissa, 13.2.2025
Mahdin kapasiteettia on laajennettu uudella pienellä osiolla, jossa on 56 laskentasolmua (7168 ydintä), ja jokaisessa niistä 3500 GiB paikallista NVMe-tallennustilaa. Tämä osio tuo käyttöön joustavan CPU-ytimiin perustuvan allokoinnin, jonka ansiosta käyttäjät voivat varata yksittäisiä ytimiä kokonaisten solmujen sijaan. Lisäksi interaktiivista osiota on parannettu neljällä solmulla, joissa on sama suuren kapasiteetin paikallinen tallennustila.
Tämä uusi kokoonpano on optimoitu pienten, CPU-intensiivisten työkuormien eräajoon, kun tarvitaan nopeaa pääsyä paikalliseen tallennustilaan. CPU-ytimiin perustuvan allokoinnin ja korkean suorituskyvyn NVMe-asemien yhdistelmä tekee tästä osiosta erityisen sopivan dataintensiivisiin tehtäviin. Nykyiset Puhdin käyttäjät, jotka työskentelevät I/O-sidonnaisten työnkulkujen parissa, saattavat pitää tätä uutta resurssia erityisen arvokkaana laskennassaan.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 24 ja 10, 30.1.2025
- VSCode on päivitetty versioon 1.96.4.
- Saavutettavuusselosteen yhteystiedot on päivitetty.
- MLflow toimii nyt taas NVME:tä käytettäessä.
- Open OnDemand päivitetty versioon 3.1.10.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 23 ja 9, 23.10.2024
- MLflow, Tensorboard ja Desktop-sovellus toimivat nyt uudemman Apptainerin kanssa.
- CPU:iden määrä GPU:ta kohden on nyt rajoitettu 10:een.
- Linkki MyCSC:hen on korjattu.
- Puhti: Accelerated Visualization -sovelluksen fontteja on parannettu.
- Open OnDemand päivitetty versioon 3.1.9.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 22 ja 8, 28.8.2024
- Jupyter-sovelluksen käynnistyslomaketta on parannettu.
- Python-moduulien moduuliversio voidaan nyt valita pudotusvalikosta.
- Käyttöliittymää Python-ympäristön laajentamiseen lisäpaketeilla on yksinkertaistettu.
- MLflow-sovelluksen käynnistyslomake listaa nyt kaikki saatavilla olevat pytorch-moduuliversiot.
- Selainkäyttöliittymien suorituskykyä on parannettu.
- Compute node shell tukee nyt useiden instanssien ajamista samalla solmulla.
- Open OnDemand päivitetty versioon 3.1.7.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 21 ja 7, 13.6.2024
- VSCode päivitetty versioon 1.89.1.
- Jupyter-sovelluksen pitäisi toimia paremmin selainkäyttöliittymän ulkopuolella luotujen virtuaaliympäristöjen kanssa.
- Puhti: RStudiossa on nyt saatavilla R-versio 4.4.0.
- Puhti: VisIt päivitetty versioon 3.3.3. Joitakin aiemmin puuttuneita riippuvuuksia on nyt asennettu.
- Open OnDemand päivitetty versioon 3.1.5.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 20 ja 6, 27.5.2024
- Pilvitallennuksen määrityssovellus voi nyt määrittää yhteyksiä LUMI-O:hon.
Puhdin ja Mahdin selainkäyttöliittymät päivitetty julkaisuihin 19 ja 5, 10.4.2024
- Lustren ja muiden ongelmien aiheuttamien virheiden virhesivuja on parannettu.
- Desktop-sovelluksen pääte tukee nyt Slurm-töiden lähettämistä.
- Desktop-sovelluksen pääte käyttää nyt oletusarvoista
$XDG_CONFIG_HOME-asetusta mukautetun sijainnin sijaan. - Hakemistojen lataaminen toimii nyt taas oikein.
- Saavutettavuusseloste on päivitetty ja joitakin saavutettavuusongelmia on korjattu.
- Open OnDemand päivitetty versioon 3.1.4
Puhdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 18, 5.3.2024
- Allasta ja IDA:a voidaan nyt käyttää tiedostoselaimessa.
- Pilvitallennuksen määritystyökalu käyttöoikeustunnisteiden luomiseen Altaaseen on nyt saatavilla.
- Desktop- ja Accelerated Visualization -sovelluksia on parannettu.
- Accelerated Visualization käynnistää nyt saman työpöydän kuin Desktop-sovellus.
- Accelerated Visualization -sovelluksen sovellukset löytyvät nyt työpöydän sovellusvalikosta.
- VisIt on nyt saatavilla Accelerated Visualizationissa.
- Sovellusten käynnistyksen pitäisi olla luotettavampaa.
- Pääteikkuna pysyy auki, jos sovellusten käynnistyksessä tapahtuu virheitä.
- Sovellukset on nyt luokiteltu valikossa.
- Varausten käsittelyä on parannettu.
- Tulevat varaukset näytetään nyt.
- Kaikkia varauksia voidaan nyt käyttää missä tahansa sovelluksessa osiosta riippumatta.
- Varausten välimuistitusta on parannettu, jotta tiedot ovat ajantasaisempia.
- Työn kesto rajoitetaan nyt automaattisesti varauksen pituuden mukaan.
- MATLAB päivitetty versioon r2023b.
- VSCode päivitetty versioon 1.86.1.
- TensorBoard ja MLflow voivat nyt käyttää oletusmoduuliversioita.
- Open OnDemand päivitetty versioon 3.1.1.
Mahdissa on saatavilla pieniä GPU:ita interaktiiviseen työskentelyyn, 5.3.2024
Neljä (4) Mahdin A100-GPU:ta on jaettu yhteensä 28 pienempään GPU:hun, joissa on vain osa täyden A100-GPU:n laskenta- ja muistiresursseista. Näissä a100_1g.5gb-GPU:issa on yksi seitsemäsosa yhden A100-GPU:n laskentatehosta ja yhteensä 5 Gt muistia. Ne soveltuvat interaktiiviseen työskentelyyn, kursseille ja koodin kehittämiseen, ja ne ovat saatavilla myös selainkäyttöliittymän kautta. Katso lisätiedot täältä.
Mahdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 4, 27.2.2024
- GPU:t (MIG) ovat nyt saatavilla sovelluksissa gpusmall-osiossa.
- Desktop-sovellusta on parannettu
- Sovellusten käynnistyksen pitäisi olla luotettavampaa.
- Pääteikkuna pysyy auki, jos sovellusten käynnistyksessä tapahtuu virheitä.
- Sovellukset on nyt luokiteltu valikossa.
- VSCode päivitetty versioon 1.86.1.
- TensorBoard ja MLflow voivat nyt käyttää oletusmoduuliversioita.
- Open OnDemand päivitetty versioon 3.1.1.
SSH:n tietoturvapäivitykset kryptografia-asetuksiin, 12.1.2024
Äskettäin julkaistiin uusi SSH-haavoittuvuus nimeltä Terrapin (CVE-2023-48795), joka kuvaa
heikkouksia avaintenvaihdossa tiettyjä salauksia käytettäessä.
Tämän seurauksena Puhdin ja Mahdin kirjautumissolmut on päivitetty estämään heikkojen
salausten käyttö: chacha20-poly1305@openssh.com ja kaikki EtM-salausvariantit.
Tämä muutos otettiin käyttöön perjantaina 12.1.2024 noin kello 13 Suomen aikaa.
Tämä muutos näyttää aiheuttaneen sen, että monet Windowsin OpenSSH-asiakasohjelmat käyttävät salauksen ja MAC-algoritmin yhdistelmää, joka ei toimi. Tuloksena on viesti "Corrupted MAC on input". Tämä on tunnettu ongelma Windowsissa, ja siihen voidaan käyttää väliaikaista ratkaisua lisäämällä eksplisiittiset asetukset käytettäville MAC-algoritmeille.
Katso lisätiedot UKK-sivultamme ongelmasta.
Mahdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 3, 12.12.2023
- Varausten käsittelyä on parannettu.
- Tulevat varaukset näytetään nyt.
- Kaikkia varauksia voidaan nyt käyttää missä tahansa sovelluksessa osiosta riippumatta.
- Varausten välimuistitusta on parannettu, jotta tiedot ovat ajantasaisempia.
- Työn kesto rajoitetaan nyt automaattisesti varauksen pituuden mukaan.
- Jupyter for Courses sallii nyt myös varauksen määrittämisen kurssiympäristön YAML-tiedostossa.
- Jupyter for Courses ja TensorBoard näyttävät nyt virheitä, jos moduuli tai lokipolku jätetään tyhjäksi.
- Selainkäyttöliittymän istunnon kesto on kasvatettu 12 tuntiin aiemmasta 8 tunnista.
- Umask asetetaan nyt oikein. Tämä vaikuttaa tiedostoselaimella luotuihin tiedostoihin.
- Selainvälimuisti validoidaan nyt useammin päivitysten jälkeisten ongelmien välttämiseksi.
LUMIn selainkäyttöliittymä on julkaistu, 9.11.2023
Upouusi LUMIn selainkäyttöliittymä on julkaistu osoitteessa www.lumi.csc.fi! LUMIn selainkäyttöliittymä tarjoaa samat ominaisuudet kuin Mahdin ja Puhdin selainkäyttöliittymät. Lue lisää LUMIn dokumentaatiosta.
Mahdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 2, 13.10.2023
- MLflow Tracking on nyt saatavilla interaktiivisena sovelluksena.
- Allas-määritystyökalu on lisätty Allas-yhteyden määrittämistä varten.
- IDA on nyt tuettu tiedostoselaimessa.
- Desktop-sovelluksen asetukset ja kuvakkeet tallennetaan nyt istuntojen välillä.
- VSCode päivitetty versioon 1.82.2.
- Jupyter-muistikirjat toimivat nyt VSCodessa.
- Käyttömittarit sisältävät nyt kuvauksen.
- Open OnDemand päivitetty versioon 3.0.3.
Puhdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 17, 8.9.2023
- MLflow Tracking on nyt saatavilla interaktiivisena sovelluksena.
- Jupyterissa on nyt saatavilla qiskit -moduuli.
- Muutokset Desktop-sovelluksessa:
- Työpöydän asetukset tallennetaan nyt istuntojen välillä.
- MATE-työpöytäympäristö ja yksittäisen sovelluksen käynnistys on poistettu.
- MATLAB päivitetty versioon r2023a.
- VSCode päivitetty versioon 1.80.2.
Puhdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 16, 4.7.2023
- RStudiossa on nyt saatavilla r-env 4.3.0.
- Blender päivitetty versioon 3.6.0, ja lisäosien asennuksen tuki on lisätty.
- Selainkäyttöliittymän istunnon kesto on kasvatettu 12 tuntiin aiemmasta 8 tunnista.
Mahdin selainkäyttöliittymä saatavilla, 13.6.2023
Selainkäyttöliittymä, joka oli aiemmin saatavilla vain Puhdille, on nyt saatavilla myös Mahdille osoitteessa www.mahti.csc.fi. Mahdin selainkäyttöliittymässä saatavilla olevat sovellukset:
- Active Jobs
- Compute and Login node shell
- Desktop with Maestro and VMD
- Disk quotas and Project view
- File browser with support for Allas
- Jupyter, Julia-Jupyter and Jupyter for courses
- TensorBoard
- Visual Studio Code
Uusi käytäntö Puhdissa ja Mahdissa projekteille, joiden laskutusyksiköt (BUs) ovat loppuneet, 22.5.2023
Sen lisäksi, että pääsyä laskentaresursseihin rajoitetaan laskutusyksiköiden loputtua, nyt myös pääsyä tallennustilaan rajoitetaan Puhdissa ja Mahdissa. Lue lisätietoja kohdasta laskutusyksiköiden loppuminen. Jotta kaikilla projekteilla olisi aikaa reagoida, käytäntöä aletaan soveltaa 21.6.2023 alkaen. Kirjaudu MyCSC:hen tarkistaaksesi, onko sinulla projekteja, joilla on negatiivinen määrä laskutusyksiköitä (BUs). Kun kirjaudut Puhtiin ssh:lla tai selainkäyttöliittymän kautta, saat myös varoituksia ja tietoa siitä, kuinka paljon aikaa on jäljellä ennen kuin pääsy poistetaan.
Puhdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 15, 2.5.2023
- Uusi Julia-Jupyter-sovellus on nyt saatavilla.
- Visual Studio Code -sovellus on saanut päivityksiä.
- Tuki Julian kieliominaisuuksille on lisätty.
- VSCode-versio 1.76.1 on nyt saatavilla.
- Version voi valita sovellusta käynnistettäessä.
- Puhdin käyttömittarit sisältävät nyt historian (laajenna napsauttamalla nuolikuvaketta).
- Open OnDemand päivitetty versioon 2.0.32.
Puhdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 14, 2.2.2023
- Xfce on nyt ensisijainen työpöytävaihtoehto, ja muut vaihtoehdot poistuvat käytöstä vähitellen
- MOTD on poistettu etusivulta
- Kaikki työpöydän päätteet avautuvat nyt säiliön ulkopuolella -> niiden pitäisi toimia täsmälleen kuten tavallinen kirjautumiskuori
- Host terminal on nimetty työpöydällä uudelleen nimelle Terminal
- Graafinen Emacs on nyt saatavilla työpöydällä
- Jupyter-sovellus hyväksyy nyt Python-tulkin koko polun, mikä mahdollistaa Tykky-asennusten suoran käytön.
- Työlle jäljellä oleva aika lasketaan nyt oikein ja näytetään päätteen alareunassa, kun yhteys laskentasolmun komentotulkkiin muodostetaan uudelleen.
Puhdin levynsiivouskäytäntö muuttui, 17.1.2023
- Käyttöehdot muuttuivat: nyt tiedostot, joita ei ole käytetty 6 kuukauteen, poistetaan siivousprosessissa.
Puhdin selainkäyttöliittymä päivitetty julkaisuun 13, 20.12.2022
- Uusi visuaalinen ilme.
- Uloskirjautumissivu kertoo nyt käyttäjille, miten Puhdin selainkäyttöliittymästä kirjaudutaan turvallisesti ulos.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 12, 10.11.2022
- Käyttäjän todennus tapahtuu nyt OpenID Connectin kautta, mikä tarkoittaa, että käyttäjät voivat tunnistautua Hakan tai CSC-kirjautumisen kautta. Tämä mahdollistaa kertakirjautumisen (SSO) esimerkiksi selainkäyttöliittymän ja MyCSC:n välillä.
- Uusi tervetulosivu on lisätty vanhan kirjautumissivun tilalle.
- Puhdin käyttömittarit visualisoidaan nyt uudella tavalla.
- Open onDemand päivitetty versioon 2.0.29.
Uudet kirjautumissolmut Puhdissa, 9.11.2022
Puhtiin on lisätty kaksi uutta kirjautumissolmua, puhti-login14.csc.fi ja puhti-login15.csc.fi,
ja ne on sisällytetty osoitteen puhti.csc.fi round-robin-DNS:ään.
Käytä komentoa ssh <username>@puhti-login<11-12,14-15>.csc.fi, jos sinun täytyy
muodostaa yhteys tiettyyn kirjautumissolmuun, esimerkiksi ssh kkayttaj@puhti-login14.csc.fi.
Puhdin käyttöjärjestelmä päivitetty RHEL8:aan, 5.10.2022
Puhdin käyttöjärjestelmä on päivitetty Red Hat Enterprise Linuxista (RHEL) 7 versioon RHEL 8.
- Esiasennetut ohjelmistot ja kirjastot sekä dokumentaatio on päivitetty
- Oletuskääntäjäpino on nyt
gcc/11.3.0,openmpi/4.1.4jaintel-oneapi-mkl/2022.1.0. Katso lisätiedot. - Huomaa, että
hpcx-mpion poistettu ja korvattuopenmpi:llä - Käyttäjien tulee kääntää omat koodinsa uudelleen uudelle käyttöjärjestelmälle
- Joitakin sovellusten vanhempia versioita ei ole enää saatavilla
Huomaa, että vanhat kirjautumissolmut (puhti-login1 ja puhti-login2) eivät ole enää käytettävissä.
Uudet kirjautumissolmut on nimetty uudelleen nimiksi puhti-login11 ja puhti-login12. Myös kirjautumissolmujen ssh-avaimet
ovat muuttuneet, ja uusien avainten tarkistussummat ovat:
| SHA256 checksum | Key |
|---|---|
| kk0Tar9opQ+6Gq0GWJdWVVvFEMeI6kW1DW1VOYveT5c | ssh_host_ecdsa_key.pub (ECDSA) |
| Q2lpykI43ffs4PrRODZ/qncjUo3eyrRHc5T9yjJEwWY | ssh_host_ed25519_key.pub (ED25519) |
| WH1Ag2OQtMPZb+hj3YeH9uVMMetXpCvyNUbsdk0Qcpk | ssh_host_rsa_key.pub (RSA) |
Kun kirjaudut osoitteeseen puhti.csc.fi ensimmäistä kertaa RHEL8-päivityksen jälkeen, näet
varoituksen "WARNING: REMOTE HOST IDENTIFICATION HAS CHANGED!".
Tämä on täysin odotettua, eikä siitä tarvitse huolestua.
Varoitus katoaa, jos poistat puhti.csc.fi:n known_hosts-tiedostostasi.
Voit suorittaa seuraavan komennon: ssh-keygen -R puhti.csc.fi tai voit poistaa
ongelmallisen rivin haluamallasi tekstieditorilla. Varoitusviesti kertoo, mikä
rivin numero on ongelmallinen.
Kun olet poistanut ongelmallisen rivin, kirjaudu uudelleen normaalisti, tarkista että palvelimen tarjoama sormenjälki
vastaa jotakin yllä olevista tarkistussummista, ja kirjoita "yes" jatkaaksesi
yhteyden muodostamista. Tämän jälkeen sinun pitäisi pystyä muodostamaan yhteys osoitteeseen puhti.csc.fi normaalisti.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 10 24.8.2022
- Uusi MATLAB-sovellus on lisätty.
- Blender on lisätty Accelerated Visualization -sovellukseen.
- Lomakkeiden validointiviestejä on parannettu.
- Jupyter-sovelluksen käynnistyslomaketta on parannettu.
- pytorch-moduuli käynnistyy nyt oikein Jupyter-sovelluksessa.
- Korjattu ongelma, jossa Jupyter Lab ei toiminut Jupyter for Courses -sovelluksessa.
- VS Code päivitetty versioon 1.70.1.
- Open onDemand päivitetty versioon 2.0.28.
Puhtiin on lisätty lisää paikallisia levyjä Big Mem -solmuihin, 6.7.2022
Nopeita paikallisia NVMe-levyjä voidaan käyttää nopeuttamaan yhden solmun työkuormia, joissa tehdään paljon luku- ja kirjoitusoperaatioita aineistoille, jotka mahtuvat levyille. Erityisesti pienet luku- ja kirjoitusoperaatiot sekä suuren tiedostomäärän käsittely ovat paljon nopeampia paikallisilla levyillä kuin rinnakkaistiedostojärjestelmässä. Nyt myös kuusi solmua, joissa on 1,5 TiB muistia, on päivitetty 5960 GiB:n paikallisilla levyillä. Katso Puhdin tekniset tiedot saadaksesi yksityiskohtaisen luettelon kaikista solmuista.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 9 5.7.2022
- Kojelautaan on lisätty Lustren käyttömittareita näyttäviä kaavioita.
- Selainkäyttöliittymän suorituskykyä on parannettu erityisesti raskaan Lustre-kuorman aikana.
- Sovelluksia käynnistettäessä valitut moduulit näkyvät nyt aktiivisten istuntojen sivulla.
- Paikallista levyä on nyt käytettävä RStudioa ajettaessa.
- VS Code päivitetty versioon 1.66.2.
- Open onDemand päivitetty versioon 2.0.27.
Datan siivoaminen - automaattinen poisto, uudet työkalut ja ohjeet 10.6.2022
Puhdin rinnakkaistiedostojärjestelmä täyttyy ja sen suorituskyky heikkenee. Aloitamme käytännön toimeenpanon vanhojen tiedostojen poistamiseksi. Auttaaksemme tiedostojen hallinnassa ilman, että järjestelmään kohdistuu liiallista kuormaa, olemme päivittäneet ohjeemme datan siirtämisestä, poistamisesta tai arkistoinnista.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 8 25.5.2022
- Uusi Accelerated Visualization -sovellus on lisätty GPU-kiihdytettyjen sovellusten ajamiseen.
- Kojelaudan pääsivun asettelua on parannettu.
- Kirjautumissivun asettelua on parannettu.
- Kotihakemiston kiintiöstä on lisätty näkyvämpiä varoituksia.
- CSC:n käyttöoppaiden linkit on lisätty kaikkiin sovelluksiin.
- Open onDemand päivitetty versioon 2.0.24.
Puhtiin on lisätty lisää paikallisia levyjä, 13.5.2022
Nopeita paikallisia NVMe-levyjä voidaan käyttää nopeuttamaan yhden solmun työkuormia, joissa tehdään paljon luku- ja kirjoitusoperaatioita aineistoille, jotka mahtuvat levyille. Erityisesti pienet luku- ja kirjoitusoperaatiot sekä suuren tiedostomäärän käsittely on paljon nopeampaa paikallisilla levyillä kuin rinnakkaistiedostojärjestelmässä. Nyt 48 solmua, joissa on 192 GiB muistia, ja 12 solmua, joissa on 768 GiB muistia, on varustettu paikallisilla levyillä, joiden koko on 1490 GiB. Myöhemmin vuonna 2022 kaikki suuren muistin solmut, joissa on 1,5 TiB muistia, päivitetään 6 TiB levyillä. Nämä tulevat alkuperäisten 40 CPU-solmun ja 80 GPU-solmun lisäksi, joissa on 3600 GiB NVMe-levyt. Katso Puhdin tekniset tiedot saadaksesi yksityiskohtaisen luettelon kaikista solmuista.
Mahdin käyttöjärjestelmä päivitetty RHEL8:aan, 4.5.2022
Mahdin käyttöjärjestelmä on päivitetty Red Hat Enterprise Linuxista (RHEL) 7 versioon RHEL8.
- Esiasennetut ohjelmistot ja kirjastot, mukaan lukien dokumentaatio, on päivitetty.
- Käyttäjien tulee myös kääntää omat koodinsa uudelleen uudelle käyttöjärjestelmälle.
- Joitakin sovellusten vanhempia versioita ei ole enää saatavilla.
Huomaa, että vanhat kirjautumissolmut (mahti-login1 ja mahti-login2) eivät ole käytettävissä, ja uusilla kirjautumissolmuilla on myös uudet nimet, mahti-login11 ja mahti-login12. Myös kirjautumissolmujen ssh-avaimet ovat muuttuneet, ja uusien avainten tarkistussummat ovat:
| SHA256 checksum | Key |
|---|---|
| WC9Lb5tmKDzUJqsQjaZLvp9T7LTs3aMUYSIy2OCdtgg | ssh_host_ecdsa_key.pub (ECDSA) |
| tE+1jA4Et1enbbat1V3dMRWlLtJgA8t7ZrkyIkU4ooo | ssh_host_ed25519_key.pub (ED25519) |
| 0CxM3ECpD2LhAnMfHnm3YaXresvHrhW4cevvcPb+HNw | ssh_host_rsa_key.pub (RSA) |
Kun kirjaudut osoitteeseen mahti.csc.fi ensimmäistä kertaa RHEL8-päivityksen jälkeen, näet
varoituksen "WARNING: REMOTE HOST IDENTIFICATION HAS CHANGED!".
Tämä on täysin odotettua, eikä siitä tarvitse huolestua.
Varoitus katoaa, jos poistat mahti.csc.fi:n known_hosts-tiedostostasi.
Voit suorittaa seuraavan komennon: ssh-keygen -R mahti.csc.fi tai voit poistaa
ongelmallisen rivin haluamallasi tekstieditorilla. Varoitusviesti kertoo, mikä
rivin numero on ongelmallinen.
Kun olet poistanut ongelmallisen rivin, kirjaudu uudelleen normaalisti, tarkista että palvelimen tarjoama sormenjälki vastaa jotakin yllä olevista tarkistussummista, ja kirjoita "yes" jatkaaksesi yhteyden muodostamista. Tämän jälkeen sinun pitäisi pystyä muodostamaan yhteys osoitteeseen mahti.csc.fi normaalisti.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 7 23.3.2022
- Jupyter kursseille -sovellus tukee nyt kurssiympäristöjen luomista projekteille.
- Puhdin käyttökaaviot on lisätty kojelautaan.
- Evästekäytäntö- ja saavutettavuusselostesivut on lisätty.
- Joitakin käyttöliittymäkorjauksia ja pieniä virheenkorjauksia.
- Open onDemand päivitetty versioon 2.0.23.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 6 2.2.2022
- Sovelluksille on mahdollista valita Slurm-varaus
- Uusi Jupyter-sovellus kursseille.
- Open onDemand päivitetty versioon 2.0.22.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 5
- Uusi TensorBoard-sovellus TensorFlow-ajojen visualisointiin on lisätty.
- Sovelluksia käynnistettäessä näkyvät nyt vain valitulle projektille saatavilla olevat osiot.
- Rclone-sovellus on poistettu.
- Open onDemand päivitetty versioon 2.0.20.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 4 30.11.2021
- Jupyter-muistikirjoille voi nyt käyttää mukautettuja Python-ympäristöjä, katso Jupyter-dokumentaatio.
- Uusi Compute node shell -sovellus on lisätty. Se tarjoaa pysyvän komentotulkin laskentasolmulla komennoille, joita ei pidä ajaa kirjautumissolmuilla.
- Sovelluskortit näyttävät työn päättymisen jälkeen enemmän tietoa resurssien käytöstä (seff-tuloste)
- Interaktiiviset lomakkeet voi palauttaa oletusasetuksiin
- Rclone-sovellus varoittaa nyt puuttuvasta Allas-todennuksesta
- Desktop-sovellukseen on lisätty pääte säiliön ulkopuolelle
- Kiintiö- ja BU-varoitukset voidaan nyt piilottaa
- Open onDemand päivitetty versioon 2.0.19
Puhdin selainkäyttöliittymän beta päivitetty julkaisuun 3 9.11.2021
- Sovelluskortit näyttävät nyt enemmän tietoa resursseista ja sovelluksen sulkemisen syystä ongelmien selvittämisen helpottamiseksi.
- Erilaisia sovellusparannuksia, erityisesti Rcloneen.
- Sovellusten käynnistyksen aikakatkaisuja on pidennetty.
- Epäonnistuneet kirjautumiset näyttävät nyt virheilmoituksen.
Puhdin selainkäyttöliittymän beta (julkaisu 2) on saatavilla 18.10.2021
Helppokäyttöinen selainkäyttöliittymä Puhtiin on nyt avoinna beta-testikäyttöön osoitteessa https://www.puhti.csc.fi. Uusi käyttöliittymä tarjoaa uusille käyttäjille helpon tavan käyttää Puhtia, ja kokeneille käyttäjille se tekee joidenkin ominaisuuksien käytöstä nopeampaa ja helpompaa. Katso lisätiedot kohdasta selainkäyttöliittymä
MPICH-moduulit eivät enää toimi 4.5.2021
Puhdissa huoltokatkon aikana tehdyn merkittävän verkkopinopäivityksen seurauksena MPICH-asennukset eivät enää toimi oikein, eikä niitä voida korjata helposti. MPICH:n vanhat versiot oli asennettu viimeisenä varavaihtoehtona, ja ne käyttivät viestintäkirjastoa, jonka toimittaja on nyt poistanut käytöstä. Suosittelemme ohjelmistosi uudelleenkääntämistä joko hpcx-mpi:tä tai intel-mpi:tä käyttäen. Kerro meille, jos et jostain syystä voi lainkaan työskennellä kummankaan edellä mainitun mpi-kirjaston kanssa.
MPICH-versio 3.4 UCX-tuella asennetaan Puhtiin myöhemmin, mutta tämä vie jonkin aikaa.
Slurm-päivitys ja srun-komennon käyttäytyminen 4.5.2021
Komennon srun prog & ajaminen Puhdissa tuottaa virheitä kuten "step creation still disabled, retrying (Requested nodes are busy)", jos SLURM_EXACT=1 tai SLURM_OVERLAP=1 ei ole asetettu. Katso lisätiedot osoitteesta https://slurm.schedmd.com/srun.html.