Hyppää sisältöön

Welcome to our weekly research support coffee hour on Zoom! Click here for more information.

Warning!

Puhti scratch disk is becoming very full (80+ % ) resulting in performance degradation. Everybody is advised to only keep actively processed data on scratch, all other data should be deleted, transferred to host institute or stored in Lumi-O. No new quota will be granted. Click here for a tool for examining your disk usage.

csc-env-komento

csc-env on komentorivikäyttöliittymä yleisten ohjelmointiympäristön ongelmien testaamiseen sekä kirjautumisympäristön palauttamiseen CSC:n supertietokoneilla.

Työkalu tekee palautuksen ei-tuhoavasti tallentamalla kopion nykyisistä asetuksista, jotka voidaan myöhemmin palauttaa.

  • login-settings -> Seuraavat tiedostot: .bashrc, .bash_profile ja .bash_logout käyttäjän kotihakemistossa

Virheelliset tai ylimääräiset muuttujat kirjautumisasetuksissa ovat yleinen syy outoihin ja vaikeasti jäljitettäviin ongelmiin. CSC:n tukihenkilöstö ei myöskään näe käyttäjän kirjautumisasetuksia, joten ongelmien havaitseminen on vaikeaa, ellei käyttäjä lähetä meille kirjautumisasetuksiaan. Kirjautumisasetusten väliaikainen palauttaminen järjestelmän oletusarvoihin antaa mahdollisuuden sulkea pois yhden mahdollisen syyn.

Tällä hetkellä tuetaan vain bashia

Jos käytät jotakin muuta kirjautumiskuorta (ksh, zsh ...), työkalu ei voi palauttaa kirjautumisasetuksiasi, mutta voit käyttää työkalua vaihtamiseen bashiin.

CSC:n sisäiset ssh-muutokset

RHEL8-päivityksestä alkaen ssh-yhteydet supertietokoneiden solmujen välillä eivät enää käytä avaimia ja asetuksia hakemistosta "~/.ssh", vaan käyttävät sen sijaan konetason tunnistautumista. Tämän vuoksi ssh-asetusten palautusmahdollisuus on poistettu.

Käyttö

Ohje

csc-env help näyttää kaikki käytettävissä olevat komennot ja valinnat.

Testi

csc-env test tarkistaa yleisiä käyttäjäympäristön ongelmia vertaamalla niitä oletusasetuksiin. Testituloksen voi liittää tukipyyntöösi servicedeskiin. Alla on esimerkki testitulosteesta:

csc_user@puhti $ csc-env test

Info
---------------------
User: csc_user
Host: puhti-login11
Home: /users/csc_user
Home quota
    capacity: 23%
    files:    15%
Default shell: /bin/bash 



Environment test
---------------------
PATH is modified NOTE
LD_LIBRARY_PATH has default value OK
LD_PRELOAD has default value OK
PYTHONPATH has default value OK
MODULEPATH has default value OK
MODULEPATH_ROOT has default value OK
TMPDIR has default value OK
CDPATH has default value OK
Command alias output differs NOTE
Command module list has default output OK
$HOME permission is 0700: OK
SSH folder permission is 0700: OK



File diff test
---------------------
/users/csc_user/.bashrc is modified NOTE
/users/csc_user/.bash_profile same as default OK
/users/csc_user/.bash_logout same as default OK

OK tarkoittaa, että testitulos vastaa oletusta, ja FAILED tarkoittaa, että asetus on virheellinen. NOTE ei tarkoita virhettä, vaan ainoastaan sitä, että asetusta on muutettu ja se saattaa selittää joitakin ongelmia.

Peruskäyttö

Tässä esittelemme perusmuotoisen palautus- ja palautussyklin.

csc-env reset kysyy, mitkä asetukset haluat palauttaa, tallentaa asetukset ja palauttaa ne järjestelmän oletusarvoihin. Kun ohjelma pyytää syötettä, paina valintaasi vastaavaa numeroa ja paina sitten Enteriä.

csc_user@puhti $ csc-env reset
[ INFO ] reset requires a target, please select one: 
1) login
2) shell
#? 1
[ INFO ] Files ~/.bashrc ~/.bash_profile and ~/.bash_logout have been saved to 
         /users/csc_user/.csc/csc_env_saves/login_auto/2021-01-18T14:42:44_reset_csc14 
[ INFO ] Resetting ~/.bashrc ~/.bash_profile and ~/.bash_logout 
Confirm
1) Yes
2) No
#? 1
[ INFO ] Reset completed

Kun haluat palauttaa asetukset, käytä komentoa csc-env restore. Tämä kysyy, mitkä asetukset haluat palauttaa, tallentaa nykyiset asetukset ja palauttaa sitten edellisen palautuksen aikana tallennetut asetukset.

csc_user@puhti $ csc-env restore
[ INFO ] restore requires a target, please select one: 
1) login
2) shell
#? 1
[ INFO ] Files ~/.bashrc ~/.bash_profile and ~/.bash_logout have been saved to
         /users/csc_user/.csc/csc_env_saves/login_auto/2021-01-18T14:47:59_restore_csc15 
[ INFO ] Restoring .bashrc .bash_profile and .bash_logout from 
         /users/csc_user/.csc/csc_env_saves/login_auto/2021-01-18T14:42:44_reset_csc14 
Confirm
1) Yes
2) No
#? 1
[ INFO ] Restore was completed

Jos ajat vahingossa komennon csc-env reset kaksi kertaa peräkkäin, älä hätäänny, tiedostosi eivät ole kadonneet. Katso seuraavasta luvusta ohjeet niiden palauttamiseen.

Edistynyt käyttö

Komentojen suorittaminen puhtaassa ympäristössä

Komennolla csc-env run-base käyttäjä voidaan siirtää uuteen komentotulkkiin, jossa käyttäjän tekemiä muutoksia ei ole mukana. Tämä on hyödyllistä testauksessa ja virheenjäljityksessä ilman muutoksia mihinkään tiedostoihin. Komennon suorittaminen puhtaassa ympäristössä onnistuu komennolla csc-env run-base -- -c "command args"

Huomaa, että puhdas tarkoittaa tässä oletuskirjautumisasetuksia (eli oletusmoduulit ladataan)

Tallennusten luominen ja valitseminen käsin

Jokainen komennon csc-env reset tai csc-env restore suoritus tallentaa automaattisesti valitut nykyiset asetukset. Komento csc-env list-saved listaa kaikki tallennukset:

csc_user@puhti $ csc-env list-saved
Available restores in /users/csc_user/.csc/csc_env_saves

login
---------------------
MY_SAVE  save  2021-01-08T12:14:04

csc7  restore  2021-01-18T14:52:34
csc6  restore  2021-01-18T14:51:55
csc5  reset    2021-01-18T14:51:37
csc4  reset    2021-01-18T14:51:34

Ensimmäinen sarake on tallennuksen nimi, toinen on tallennuksen luonut toiminto ja viimeinen sarake on tallennuksen luontiaika.

Jos haluat valita tietyn tallennuksen, josta palautetaan, voit käyttää --sname-valitsinta: csc-env --sname=csc4 restore Jos et halua valita kohdetta joka kerta erikseen, voit määrittää sen myös komentorivillä: csc-env --sname=csc4 --target=login restore

Komentoa csc-env save voidaan käyttää asetusten tallentamiseen niitä muuttamatta. Sekä save että reset hyväksyvät myös valitsimen --sname, jolla tallennukselle voi antaa oman nimen (automaattisen csc(numero)-nimen sijaan). Huomaa, että csc-env restore valitsee oletuksena uusimman automaattisesti nimetyn tallennuksen, joka on luotu komennolla save tai reset

Jos et jostain syystä pidä tallennusten oletussijainnista ($HOME/.csc/csc_env_saves), voit muuttaa sitä valitsimella --sdir=/path/to/save/dir. Tällöin työkalu sekä luo uudet tallennukset että etsii olemassa olevia tästä hakemistosta.

Poista koko tallennushakemisto komennolla csc-env remove-saved. Varoitus! tämä poistaa pysyvästi kaikki hakemiston tallennukset.

Lisäksi on olemassa joitakin muita valintoja, jotka voit nähdä komennolla csc-env help

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta