Hyppää sisältöön

Docs CSC now features an automatic Finnish translation. Click here for more information.

Warning!

Puhti and Mahti will be decommissioned after Roihu becomes available. Users should clean up unnecessary files and move any required data by the end of August 2026. See the Roihu data preparation instructions for details.

Puhti scratch is very full: keep only active data there and move or delete everything else. No new Puhti scratch quota will be granted.

Miten voin liittää Allas-S3-ämpärini cPoudassa toimivaan virtuaalikoneeseen

Yhdistämällä cPoudan pilviympäristön ja Allas-tallennusympäristön voit rakentaa skaalautuvia datanhallintaympäristöjä. Tämä dokumentti näyttää yhden esimerkin siitä, miten voit yhdistää nämä kaksi palvelua liittämällä ämpärin Altaasta Ubuntu 22.04:ään (testattu myös Ubuntu 20.04:llä ja 18.04:llä) tai Centos7-pohjaiseen virtuaalikoneeseen, joka toimii cPoudassa.

OpenStackin, s3cmd:n ja s3fs:n asentaminen

Ubuntu 22.04 LTS:ssä (toimii myös Ubuntu 20.04:ssä ja 18.04:ssä)

  • Kun olet käynnistänyt Ubuntu-pohjaisen virtuaalikoneen cPoudassa, avaa pääteyhteys virtuaalikoneeseen ja päivitä se komennolla:

    sudo apt update
    

Warning

Vanhemmissa Ubuntu-versioissa on vanhempia ja käytöstä poistuneita Python-versioita. On suositeltavaa käyttää uusinta Poudassa saatavilla olevaa Ubuntu-versiota.

  • Asenna sitten OpenStack-asiakasohjelma komennolla:

    sudo apt install python3-pip python3-dev python3-setuptools
    sudo pip install --upgrade pip
    sudo pip install python-openstackclient
    

    Info

    Ubuntu 18.04:ssä kirjoita nämä komennot:

    sudo apt install python3-pip python3-dev python3-setuptools
    sudo pip3 install --upgrade pip
    sudo pip install python-openstackclient --ignore-installed PyYAML
    

    Jos jätät pois --ignore-installed PyYAML, saat virheilmoituksen:

    Cannot uninstall 'PyYAML'. It is a distutils installed project and thus we cannot accurately determine which files belong to it which would lead to only a partial uninstall.
    
    Se on asennettu distutils-työkalulla, joten poistoprosessi ei voi varmistaa, mitkä tiedostot kuuluvat siihen.

  • Asenna seuraavaksi s3cmd- ja s3fs-komennot virtuaalikoneellesi.

    sudo apt install s3cmd s3fs
    

Centos7:ssä (ylläpitopäivitysten EOL 2024-06-30)

  • Kun olet käynnistänyt Centos7-pohjaisen virtuaalikoneen cPoudassa, avaa pääteyhteys virtuaalikoneeseen ja päivitä se komennolla:

    sudo yum update
    
  • OpenStackin ja s3cmd:n voi sitten asentaa komennolla:

    sudo yum install python3 python3-devel wget
    sudo python3 -m pip install --upgrade pip
    sudo python3 -m pip install python-openstackclient
    sudo yum install s3cmd
    
  • s3fs-fuse voidaan asentaa tällä komennolla:

    sudo yum install s3fs-fuse
    

Allaksen määrittäminen ja käyttö

Käytä s3cmd:tä tiedostojen lukemiseen ja kirjoittamiseen

Kun openstack, s3cmd ja s3fs on asennettu, lataa ja suorita poutaos_configure-työkalu määrittääksesi s3cmd:n käyttämään cPouta-projektiasi. Voit käyttää tätä työkalua myös vaihtamaan eri Allas-projektien välillä, jos sinulla on niitä useita.

wget https://a3s.fi/tools/poutaos_configure
chmod u+x poutaos_configure
./poutaos_configure

poutaos_configure kysyy ensin CSC-käyttäjätunnustasi ja salasanaasi. Näet CSC-käyttäjätunnuksesi MyCSC-profiili -sivulla, ja voit myös vaihtaa salasanasi siellä. Sen jälkeen työkalu listaa Allas-projektisi ja pyytää sinua antamaan käytettävän projektin. Lopuksi se kysyy chunk size -arvoa; on suositeltavaa jättää oletusarvo käyttöön.

Tämän jälkeen voit käyttää Allas-projektisi tallennusaluetta s3cmd-komennoilla. Voit nyt tarkastella, ladata ja siirtää tiedostoja tähän ämpäriin s3cmd:llä.

  • Listaa kaikki ämpärisi:
$ s3cmd ls s3://
2022-10-17 07:03  s3://data-europe
2020-09-17 11:12  s3://images-sky
2020-11-06 13:56  s3://case_1
  • Oletetaan, että sinulla on jo Altaassa ämpäri nimeltä case_1 ja että tässä ämpärissä on joitakin dataobjekteja (eli tiedostoja).
$ s3cmd ls s3://case_1
2022-10-17 07:14     67213268  s3://case_1/file1.txt
  • Tiedoston noutaminen:
s3cmd get s3://case_1/file1.txt
  • Uuden tiedoston siirtäminen:
s3cmd put file2.txt s3://case_1/

Tämä on suositeltu tapa käyttää Allasta S3-protokollalla komentorivikäyttöliittymästä. On kuitenkin myös mahdollista liittää ämpäri virtuaalikoneeseesi niin, että se näkyy "liitettynä levynä". Voit käyttää siihen s3fs:ää.

Käytä s3fs:ää kansion liittämiseen virtuaalikoneeseesi

  1. Tee tätä varten ensin tyhjä hakemisto (esimerkiksi os_case_1), jota käytetään liitospisteenä:

    mkdir os_case_1
    

    Info

    Mitä tahansa tyhjää hakemistoa voidaan käyttää liitospisteenä

  2. Luo kotihakemistoosi .passwd-s3fs-tiedosto. Tiedoston muodon on oltava: ACCESS_KEY_ID:SECRET_ACCESS_KEY, ja sillä on oltava 600-oikeudet. (Projektisi on oltava sourcettu: source project_xxxxxxx)

    $ openstack ec2 credentials list -f value | grep $OS_PROJECT_ID | tail -1 |\
       awk '{print $1":"$2}' >.passwd-s3fs
    Password:
    $ chmod 600 .passwd-s3fs
    
  3. käytä sitten s3fs-komentoa ämpärin liittämiseen.

    s3fs case_1 os_case_1 -o passwd_file=~/.passwd-s3fs -o url=https://a3s.fi/ \
        -o use_path_request_style -o umask=0333,uid=$(id -u)
    

    Info

    Komennon id -u palauttaman uid-arvon pitäisi olla oletuskäyttäjällä 1000

    Info

    Umask-arvo 0333 liittää tiedostot vain luku -tilassa. Jos haluat liittää ne luku- ja kirjoitustilassa, käytä sen sijaan arvoa 0027

  4. Tämän jälkeen sinun pitäisi nähdä liitetyn ämpärin objektit tiedostoina. Kokeile esimerkiksi komentoa:

    ls -l os_case_1
    

    Tulosteen pitäisi olla sama kuin komennolla s3cmd ls s3://case_1

    Info

    Voit myös tarkistaa liitoksen kirjoittamalla komennon df -h

  5. Kun olet valmis, voit irrottaa kansion komennolla:

    sudo umount os_case_1
    

Suomenkielinen tekoälykäännös

Sisällössä voi esiintyä virheellistä tietoa tekoälykäännöksestä johtuen.

Klikkaa tästä antaaksesi palautetta